特发性肺纤维化和炎症性肠病共同核心基因特征及其生物学机制的鉴定

目的 基于生物信息学研究介导特发性肺纤维化(IPF)和炎症性肠病(IBD)共存的潜在关键分子和通路。方法 通过美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因表达综合数据库(GEO)下载IPF(GSE110147)和IBD(GSE752141)数据集。使用R的“limma”包分析差异表达基因(DEGs)。对DEGs进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。利用STRING数据库和Cytoscape软件进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建、模块构建和核心基因鉴定。在IPF的GSE53845和IBD的GSE59071数据中对核心基因进行验证。基于NetworkAnalyst Web平台，构建转录因子(TFs)-核心基因与TFs-微小核糖核酸(miRNAs)的相互作用网络。结果 筛选出67个上调基因和23个下调基因进行后续分析。利用CytoHubba和MCODE插件鉴定出6个重要的枢纽基因，包括SPP1、COL1A1、POSTN、MMP7、COL3A1和COL6A3。在TFs基因相互作用网络中，SPP1与其他TFs的相互作用率最高。HINFP、POU2F2、YY1、F...