猴痘病毒相关蛋白A42R的生物信息学及分子对接分析

目的 通过生物信息学及分子对接分析以了解猴痘病毒(monkeypox virus, MPXV)相关蛋白A42R的结构特征、抗原表位以及小分子抑制物。方法 利用生物信息学和分子对接技术对MPXV A42R蛋白的开放阅读框、蛋白同源性、理化性质、翻译后修饰位点、二级/三级结构、B/T细胞抗原表位、配体结合位点以及小分子化合物等进行预测分析。结果 A42R蛋白由133个氨基酸组成，分子质量为15.003 42 ku,理论等电点9.36。该蛋白与天花病毒、骆驼痘病毒、痘苗病毒、牛痘病毒的序列一致性高，而且与天花病毒有最近的共同祖先。A42R蛋白以不规则卷曲为主要结构，属于亲水性蛋白；含有2个O-糖基化位点、1个N-糖基化位点和14个磷酸化位点；含有5个B细胞抗原表位，23个CLT细胞抗原表位，16个Th细胞抗原表位，6个抗原决定簇；含有8个可能的配体结合区，10个潜在的分子化合物。结论 A42R为亲水性蛋白，含有丰富的B、T细胞抗原表位和配体结合区，可为抗猴痘病毒药物和疫苗的设计与开发提供参考。