| 柯萨奇病毒A组19型VP1蛋白生物信息学分析 |
| |
| 引用本文： | 杨亚文,冯琳琳,陶玲,徐银兰,徐鹏卫,晋乐飞,吴卫东.柯萨奇病毒A组19型VP1蛋白生物信息学分析[J].中国病原生物学杂志,2024(3):249-256+262. |
| |
| 作者姓名： | 杨亚文 冯琳琳 陶玲 徐银兰 徐鹏卫 晋乐飞 吴卫东 |
| |
| 作者单位： | 1. 新乡医学院公共卫生学院;2. 新乡医学院三全学院医学检验学院;3. 郑州大学公共卫生学院 |
| |
| 基金项目： | 河南省科技攻关项目(No.222102310641)； |
| |
| 摘 要： | 目的 分析柯萨奇病毒A组19型(coxsackievirus A19,CVA-19)VP1蛋白的理化性质、结构功能并预测其线性B细胞表位和T细胞表位。方法 应用ProtParam分析CVA-19 VP1蛋白的理化性质；ProtScale预测其亲疏水性；使用SignalP 6.0、DeepTMHMM、NetPhos-3.1和Motif Scan分别预测CVA-19 VP1蛋白的信号肽、跨膜结构域、磷酸化位点和脂酰化位点；利用NetCGlyc-1.0、NetNGlyc-1.0和NetOGlyc-4.0分别预测CVA-19 VP1蛋白的C-甘露糖基化位点、N-糖基化位点和O-N-乙酰半乳糖胺(N-acetylgalactosamine, GalNAc)(粘蛋白型)糖基化位点；通过SOPMA和SWISS-MODEL在线工具分别预测CVA-19 VP1蛋白的二级结构和三级结构；使用网络服务器IEDB、Bepipred 3.0、ABCpred和SVTMrip联合预测其线性B细胞表位；应用IEDB和SYFPEITHI综合预测其T细胞表位。结果 CVA-19 VP1蛋白的分子质量为33.099 ku,...
|
| 关 键 词： | 柯萨奇病毒A组19型 VP1蛋白 抗原表位 生物信息学 |
|
|
