基于网络药理学和生物信息学探讨并验证槲皮素治疗肝癌的靶点和机制 |
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引用本文: | 柳卓,谭小宁,翦慧颖,曾普华.基于网络药理学和生物信息学探讨并验证槲皮素治疗肝癌的靶点和机制[J].中国中医基础医学杂志,2023(11):1904-1911. |
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作者姓名: | 柳卓 谭小宁 翦慧颖 曾普华 |
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作者单位: | 1. 长沙医学院;2. 湖南省中医研究院;3. 湖南省中医药研究院附属医院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(82074425);;湖南省自然基金项目(2021JJ30417); |
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摘 要: | 目的 采用网络药理学方法分析槲皮素治疗肝癌的相关分子生物学机制。方法 TCMSP数据库和Pubchem数据库筛选出槲皮素作用靶点,GeneCards、OMIM和TTD数据库筛选出肝癌疾病作用靶点。利用Ri386 4.0.5软件、STRING数据库和Cytoscape 3.6.2进行蛋白互作分析,利用R语言程序、GlueGO和DAVID 6.8进行GO和KEGG信号通路富集分析,利用iGEMDOCK软件和Systemsdock数据库进行分子对接来预测槲皮素对肝癌的结合作用。采用CCK8检测槲皮素对HepG2、Hep3B、Huh-7三种肝癌细胞增殖影响,ELISA法检测槲皮素干预HepG2细胞后肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)-α、白细胞介素(interleukin,IL)-6、IL-1β水平,Western blot和高内涵细胞成像分析系统分别检测槲皮素干预HepG2细胞前后醛糖还原酶(aldoketo reductase family 1 member B1,AKR1B1)的表达。结果 筛选出槲皮素的自身靶点299个,筛选出槲皮素作用于肝癌的靶点70个...
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关 键 词: | 槲皮素 肝癌 分子对接 网络药理学 实验验证 |
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