中枢神经系统脱髓鞘疾病患者外周血白细胞环状RNA表达谱的生物信息学分析

目的 通过对Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中公共的数据集进行数据挖掘,找出中枢神经系统脱髓鞘疾病患者外周血白细胞中差异表达的环状RNA(circRNA),并从理论上预测其功能。方法 从GEO数据库中检索中枢神经脱髓鞘患者白细胞的circRNA表达数据集,应用DESeq2算法计算差异表达的circRNA,将不同数据集得到的差异表达circRNA进行比对,找出共同差异表达的circRNA。对差异表达的circRNA的母源基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,揭示其可能的功能。最后,在实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠外周血白细胞中对小鼠同源的circRNA进行实时定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)验证其变化趋势。结果 通过检索GEO数据库,筛选出2个多发性硬化(MS)外周血白细胞数据集,获得263个差异表达的circRNA。其中,hsa_circ₀040823、hsa_circ₀018992、hsa_circ_...