基因芯片筛选LNCaP与C4-2细胞中P53信号通路相关差异表达基因 |
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引用本文: | 金桂花,王丽娟,朱青,周侠,李萌,白娥.基因芯片筛选LNCaP与C4-2细胞中P53信号通路相关差异表达基因[J].西部医学,2014(3):272-275. |
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作者姓名: | 金桂花 王丽娟 朱青 周侠 李萌 白娥 |
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作者单位: | 西安交通大学医学院第一附属医院肿瘤中心肿瘤科,陕西西安710061 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(81272200,81072117) |
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摘 要: | 目的运用基因芯片筛选雄激素依赖性前列腺癌细胞系LNCaP与雄激素非依赖性前列腺癌细胞系C4-2中p53信号通路相关差异表达基因,寻找去势抵抗性前列腺癌的可能发生机制。方法体外培养前列腺癌细胞系LN-CaP和C4-2,TRIzol试剂提取两种细胞的总RNA并纯化,按Agilent芯片说明对总RNA进行杂交,所得荧光信号采用AligentScanner、Imagene和Genespring软件进行分析和显示。结果以LNCaP为对照,C4-2细胞中3组均表达差异的基因共417个,上调基因301个,下调基因116个。KEGG转录域覆盖率分析显示,差异表达基因中与p53信号通路相关的占9.3%;p53信号通路中表达差异的基因分别为ATR、p21、CDK4/6、CyclinE、Gadd45、PfGs、CytC、IGF-BP3、TSPl、p53R2、Sestrins和CyclinG,其中p21、CDK4/6、CyclinE的表达差异最显著。结论筛选出在LNCaP和C4-2细胞系p53信号通路中差异表达基因12个,其中p21、cDK4/6、CyclinE可能参与了CRPC的发生发展,为进一步研究前列腺癌的进展机制奠定了基础。
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关 键 词: | 基因芯片技术 LNCaP细胞 C4-2细胞 P53信号通路 前列腺癌 |
Differential expressed genes of p53 signaling pathway in prostate cancer cell lines LNCaP and C4-2 screened by microarray technology |
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Institution: | JIN Gui-hua, WANG Li-juan, ZHU Qing,et al (Department of Oncology, The First Affiliated Hospital of Medical College, Xi'an Jiaotong University, Xi' an 710061) |
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Abstract: | |
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Keywords: | Microarray technology LNCaP Cell C4-2 Cell p53 signaling pathway Prostate cancer |
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