骨性关节炎滑膜病变的生物信息分析

目的：通过生物信息分析探索骨性关节炎中滑膜组织的基因变化。方法：从GEO数据库中获取GSE55235和GSE12021数据，分析数据得到差异表达基因（DEGs）。再对DEGs进行功能富集分析、蛋白互作网路分析、hub基因分析等。最后分析预测与hub基因相关的转录因子和miRNA，构建互作网络。结果：通过分析得到249个DEGs，再对其进行功能富集分析发现炎性反应、细胞外基质和细胞外区域以及TNF信号通路有更多的基因富集。此外，从DEGs中筛选出10个hub基因，进行转录因子和miRNA分析，得到242个转录因子和212个miRNA与之相关。结论：对OA滑膜组织的差异基因分析，不难发现，在OA的发展过程中，滑膜组织的基因发生明显的变化，并主要涉及炎性调控、炎性反应等过程。同时预测了可能与一些关键基因相关的转录因子和miRNA，进一步揭示了分子调控网络。