生物信息学分析OLFML2B基因在胃癌中的功能及临床预后价值 |
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作者姓名: | 欧阳佳凤 刘罗根 李国庆 |
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作者单位: | 1.南华大学附属第二医院,消化内科,湖南 衡阳,421001;2.南华大学附属第二医院,临床医学研究中心,湖南 衡阳,421001 |
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基金项目: | 湖南省卫生计生委2017年度第二批科研计划项目(A2017014);2020年湖南省研究生科研创新项目(CX20200977)。 |
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摘 要: | 目的 采用生物信息学方法分析OLFML2B基因在胃癌中的表达、功能及预后价值。方法 从Oncomine数据库挖掘胃癌中OLFML2B基因的表达信息,利用Kaplan-Meier plotter数据库分析OLFML2B在胃癌中的预后价值,并使用UALCAN数据验证胃癌中OLFML2B的表达水平及预后价值,最终通过LinkedOmics数据库探索胃癌中与OLFML2B相关的基因及可能的生物学过程。结果 Oncomine 数据库共纳入了319项OLFML2B在不同肿瘤中的研究结果,差异有统计学意义的共39项(均表现为OLFML2B在肿瘤中高表达),其中6项分析显示OLFML2B在胃癌中的表达较正常胃组织明显升高,包括324例样本,差异有统计学意义(Fold Change>2, P<0.000 1)。OLFML2B表达量与胃癌总体生存率呈负相关,即OLFML2B表达水平越高则患者总体生存率越低(P<0.05)。亚组分析发现,弥漫型胃癌与胃肠型胃癌患者中,OLFML2B高表达组总体生存率较低表达组明显缩短(P<0.05)。UALCAN数据库验证表明,OLFML2B在胃癌组织中高表达且与胃癌预后相关。此外,LinkedOmics数据库提示,OLFML2B可能作为癌基因,通过影响血管生成、细胞黏附和细胞周期等途径参与胃癌的发生发展。结论 与正常胃组织相比,OLFML2B在胃癌组织中的表达水平明显升高,其高表达与胃癌患者不良预后相关,可能成为胃癌预后的生物标志物,并以癌基因的角色参与胃癌的发生发展。
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关 键 词: | 胃癌 预后 OLFML2B Oncomine Kaplan-Meier Plotter |
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