| 基于转录组测序分析干旱胁迫对党参不同组织基因表达的调控 |
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| 引用本文： | 孙晓琛,栗锦鹏,原静静,王惠珍. 基于转录组测序分析干旱胁迫对党参不同组织基因表达的调控[J]. 中草药, 2022, 53(14): 4465-4475 |
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| 作者姓名： | 孙晓琛 栗锦鹏 原静静 王惠珍 |
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| 作者单位： | 甘肃中医药大学药学院, 甘肃兰州 730000;西北中藏药省部共建协同创新中心, 甘肃兰州 730000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(81760683);国家自然科学基金资助项目(81960683);现代农业产业技术体系建设专项资金资助(CARS-21);甘肃省教育厅"双一流"科研重点项目(GSSYLXM-05);研究生创新基金资助项目(2021CX48) |
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| 摘 要： | 目的 对不同干旱胁迫程度下党参Codonopsispilosula叶、茎、根进行转录组测序,探究干旱胁迫对党参差异基因和多糖合成相关酶基因的调控。方法 利用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术对正常水分（85%～90%）和轻度（65%～70%）、中度（50%～55%）、重度干旱胁迫（35%～40%）下生长旺盛期党参叶、茎、根组织进行测序并建立c DNA数据库,经de novo拼接后得到Unigene,并进一步开展生物信息学分析。结果 共获得Unigene 60 377条,分别有51 477、29 896、33 479、35 912、47 378、18 649、31 833条被非冗余数据库（non-redundant protein sequence database,NR）、真核生物蛋白相邻类的聚簇（clusters of orthologous group for eukaryotic complete,KOG）、基因本体（gene ontology,GO）、Swiss-Prot、egg NOG、京都基因与基因组数据库（Kyoto encyclopedia of ge...
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| 关 键 词： | 党参 干旱胁迫 转录组测序 差异基因表达 差异代谢通路 党参多糖生物合成 |
| 修稿时间： | 2021-11-03 |
Sequencing and analysis of transcriptome to reveal regulation gene expression in different tissues of Codonopsis pilosula under drought stress |
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| SUN Xiao-chen,LI Jin-peng,YUAN Jing-jing,WANG Hui-zhen. Sequencing and analysis of transcriptome to reveal regulation gene expression in different tissues of Codonopsis pilosula under drought stress[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2022, 53(14): 4465-4475 |
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| Authors: | SUN Xiao-chen LI Jin-peng YUAN Jing-jing WANG Hui-zhen |
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| Affiliation: | College of Pharmacy, Gansu University of Chinese Medicine, Lanzhou 730000, China;Northwest Collaborative Innovation Center for Traditional Chinese Medicine Co-constructed by Gansu Province &MOE of PRC, Lanzhou 730000, China |
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