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高通量测序研究不同程度间歇性低氧致大鼠肠道微生物菌群改变
引用本文:李雯,赵丹,万自芳,张湘燕.高通量测序研究不同程度间歇性低氧致大鼠肠道微生物菌群改变[J].重庆医学,2021,50(7):1087-1093.
作者姓名:李雯  赵丹  万自芳  张湘燕
作者单位:贵州医科大学,贵阳550004;贵州省人民医院呼吸与危重症医学科/贵州省人民医院肺脏免疫性疾病重点实验室,贵阳550002
基金项目:贵州省科技计划项目;贵州省人民医院青年基金项目
摘    要:目的 研究不同程度间歇性低氧(CIH)导致大鼠肠道菌群改变.方法 分别建立4周、8周CIH大鼠模型与对照组,留取各组大鼠粪便样品,利用Illumina MiSeq PE300平台进行高通量测序,测定所有粪便细菌的16SrRNA基因V3、V4区序列,使用Qimme软件分析菌群物种分类、物种多样性指数、样本间差异和各组生物学标志物.结果 高通量测序及相关分析显示,低氧状态下大鼠肠道菌群较对照组大鼠发生明显改变.间歇性低氧增加了α多样性(shannon指数、simpson指数,P<0.05),引起肠道菌群的改变(β多样性的非参数多元方差分析,P<0.05).间歇性低氧暴露的大鼠较对照组表现出更多的梭菌目、毛螺菌科、瘤胃球菌科等和更少的乳酸杆菌.结论 间歇性缺氧改变了大鼠粪便微生物群的组成和多样性,使得肠道菌群紊乱,进而引发一系列疾病的发生.

关 键 词:间歇性低氧  肠道菌群紊乱  高通量测序  大鼠

High throughput sequencing for studying changes of intestinal microflora in rats caused by different degrees of intermittent hypoxia
LI Wen,ZHAO Dan,WAN Zifang,ZHANG Xiangyan.High throughput sequencing for studying changes of intestinal microflora in rats caused by different degrees of intermittent hypoxia[J].Chongqing Medical Journal,2021,50(7):1087-1093.
Authors:LI Wen  ZHAO Dan  WAN Zifang  ZHANG Xiangyan
Abstract:
Keywords:
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