2013-2014年漳州市手足口病的病原学特征及分子流行病学研究

目的 了解2013-2014年漳州市手足口病的病原构成及分子流行病学特征，为漳州市手足口病的防治工作提供科学依据。方法 采用实时荧光定量反转录聚合酶链反应（Real-time RT-PCR）方法，检测2013-2014年漳州市哨点医院送检的1421份临床诊断手足口病疑似病例的标本，进行肠道病毒通用型、肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A组16型（Cox A16）的核酸检测；通过RT-PCR方法，扩增VP1区基因部分片段并测序，对非EV71及非Cox A16的肠道病毒进行分型鉴定；扩增完整VP1区基因片段并测序，构建系统进化树对EV71、Cox A16、Cox A6和Cox A10进行基因进化分析。结果 1063份标本肠道病毒通用型阳性，阳性率为74.81%，其中222份标本EV71阳性，340份Cox A16阳性，8份EV71+Cox A16阳性，493份非EV71及非Cox A16的肠道病毒阳性。随机抽取40份非EV71及非Cox A16的肠道病毒阳性标本经RT-PCR和测序进一步分型，共鉴定出38份非EV71及非Cox A16的肠道病毒，其中Cox A6型25份（65.79%，25/38），Cox A10型8份（21.05%，8/38），Cox A5型1份（2.63%，1/38），Cox A4型3份（7.89%，3/38）和Cox A9型1份（2.63%，1/38）。VP1区完整基因的进化分析显示，漳州市的EV71均属C4基因亚型的C4a进化分支，Cox A16分属B1基因亚型的B1a和B1b两个分支；Cox A6和Cox A10均与原型株及国外地区分离株的亲缘关系远，与国内地区分离株的亲缘关系近。结论 2013-2014年漳州市非EV71及非Cox A16的肠道病毒在手足口病病原谱中占有重要位置；非EV71及非Cox A16的肠道病毒型别多样，Cox A6和Cox A10为其中的优势型别。漳州市的EV71、Cox A16、Cox A6和Cox A10标本在进化树上与国内地区相应分离株共进化共循环。

Etiology and molecular epidemiology of hand,foot and mouth disease in Zhangzhou, 2013-2014