基于网络药理学结合GEO数据库的天麻治疗阿尔茨海默病潜在作用机制研究 |
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引用本文: | 莫可,朱成豪,张远帆,张伟,孙志蓉.基于网络药理学结合GEO数据库的天麻治疗阿尔茨海默病潜在作用机制研究[J].中国现代中药,2023,25(2):342-353. |
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作者姓名: | 莫可 朱成豪 张远帆 张伟 孙志蓉 |
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作者单位: | 1.北京中医药大学 中药学院,北京 102488;2.宁强县中药材产业发展中心,陕西 宁强 724400 |
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基金项目: | 财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助项目;陕西宁强县科技攻关项目(KJ2019-001) |
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摘 要: | 目的 采用网络药理学、生物信息学方法研究天麻治疗阿尔茨海默病(AD)的作用机制。方法 利用中医药整合药理学研究平台(TCMIP)、中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、SymMap、PharmMapper、GEO、GeneCards等多个数据库获取天麻活性成分及AD疾病相关靶点。运用STRING、DAVID数据库及Cytoscape软件构建天麻活性成分-靶点-通路网络,筛选关键成分,并将其与GEO数据库筛选的关键靶点导入CB-DOCK2数据库进行分子对接。通过BioGPS数据库查询了解交集靶点在人体各组织、部位的分布及表达情况。结果 筛选得到的27个天麻活性成分与AD疾病共有176个交集靶点,靶点遍及人体肝、心、肺、胰、肾、全血、全脑等组织,靶点基因功能偏向蛋白酪氨酸激酶活性、三磷酸腺苷(ATP)结合等。天麻可能通过作用于磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)、叉形头转录因子O(FoxO)、缺氧诱导因子-1(HIF-1)等通路相关的靶标起到治疗AD的作用。分子对接结果显示,天麻治疗AD的关键成分4-(4?-羟基苄氧基)苄基甲基醚、N6-(4?-羟基苄基)腺嘌呤核苷、巴利森苷J等与表皮生长因子受体(EGFR)、酪氨酸蛋白激酶2(JAK2)、整合素β3(ITGB3)、纤连蛋白1(FN1)、E3泛素蛋白连接酶(CBL)、酪氨酸蛋白磷酸酶非受体1型(PTPN1)有较好的结合力,N6-(4?-羟基苄基)腺嘌呤核苷表现最好。结论 天麻活性成分可能通过参与调控PI3K-Akt通路的相关靶点,同时调节肝、心、肺等器官正常运转,从而实现治疗AD的作用。
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关 键 词: | 天麻 阿尔茨海默病 分子对接 差异表达基因 组织特异性表达基因 |
收稿时间: | 2022/8/17 0:00:00 |
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