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苯丙芘诱导口腔上皮细胞癌变过程的差异基因表达谱分析
引用本文:李金忠,潘红芽,张志愿,周晓健,张萍,陈万涛. 苯丙芘诱导口腔上皮细胞癌变过程的差异基因表达谱分析[J]. 中国口腔颌面外科杂志, 2007, 5(1): 35-41
作者姓名:李金忠  潘红芽  张志愿  周晓健  张萍  陈万涛
作者单位:上海交通大学医学院附属第九人民医院·口腔医学院,口腔颌面外科,上海市口腔医学重点实验室,上海市口腔医学研究所,上海,200011
基金项目:国家自然科学基金;上海市重点学科建设项目
摘    要:目的:检测并分析苯丙芘诱导的口腔上皮细胞癌变过程中基因表达的变化,寻找在口腔上皮细胞癌变过程中起重要作用的基因。方法:使用课题组前期建立的一株永生化细胞系,以及经过苯丙芘诱导而逐步产生的具有成瘤性的肿瘤细胞系【首代成瘤细胞(HB-56P)及典型鳞状细胞癌细胞(HB-94P)】,通过Affymetrix U133 plus 2.0基因芯片。检测在永生化细胞(HIOEC)向成瘤细胞转化过程中的基因表达变化。使用GenSpring7.0进行标准化及单因素方差分析,通过Venn图分析差异基因在癌变不同阶段的变化,并进一步通过GO术语进行注释。对部分基因使用实时定量PCR在细胞系中进行了验证。结果:在HIOEC向HB-94P转化过程中,共有883条差异基因,大部分集中于肿瘤发生的早期阶段。差异基因主要涉及大分子代谢、信号传导等生物学过程。具有过渡金属离子结合能力、腺核苷酸结合能力及激酶活性。其蛋白产物主要是膜结合蛋白,位于核内或细胞骨架。IGFBP3、S100A8、MAP2K、KRT6B、GDF15和MET的表达基本符合芯片结果。结论:本研究检测了苯丙芘相关口腔上皮细胞癌变过程中基因表达的变化,为苯丙芘相关的口腔癌分子发病机制研究提供了基础。

关 键 词:基因芯片  癌变  口腔癌  转化细胞系
文章编号:1672-3244(2007)01-0035-07
收稿时间:2006-10-18
修稿时间:2006-12-28

Transcription signatures of an in vitro carcinogenesis process for oral cancer induced by benzo (a)pyrene
LI Jin-zhong,PAN Hong-ya,ZHANG Zhi-yuan,ZHOU Xiao-jian,ZHANG Ping,CHEN Wan-tao. Transcription signatures of an in vitro carcinogenesis process for oral cancer induced by benzo (a)pyrene[J]. China Journal of Oral and Maxillofacial Surgery, 2007, 5(1): 35-41
Authors:LI Jin-zhong  PAN Hong-ya  ZHANG Zhi-yuan  ZHOU Xiao-jian  ZHANG Ping  CHEN Wan-tao
Abstract:
Keywords:Microarray   Carcinogenesis   Oral cancer  , Transformed cell line
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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