猪附红细胞体ORF5蛋白的空间结构与B细胞抗原表位预测 |
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引用本文: | 吕晴,单思,王丽君,巴彩凤.猪附红细胞体ORF5蛋白的空间结构与B细胞抗原表位预测[J].中国人兽共患病杂志,2015(3):251-254,259. |
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作者姓名: | 吕晴 单思 王丽君 巴彩凤 |
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作者单位: | 辽河油田总医院;江西中医药大学中医基础理论分化发展研究中心;辽宁医学院实验动物中心 |
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基金项目: | 辽宁省科技基金资助项目(No.2006408002-6)~~ |
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摘 要: | 目的预测猪附红细胞体(Mycoplasma suis,M.suis)ORF5基因编码蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位。方法联合应用生物信息学软件DNAstar与在线分析软件IEDB的B Cell Epitope Prediction Tools预测M.suis ORF5蛋白的二级结构及其亲水性区域、柔韧性区域、抗原指数、表面可及性等结构特征,经综合分析后预测其B细胞优势抗原表位。结果经分析可见,M.suis ORF5蛋白具有较为规则的二级结构,潜在的优势B细胞抗原表位为GGVDGGRD、GMRLPEDSR、EGHPDLESAR氨基酸区段。结论预测出M.suis ORF5蛋白二级结构和B细胞抗原表位,为M.suis免疫原性研究提供新手段,为病原微生物免疫原性研究提供新思路。
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关 键 词: | 猪附红细胞体 ORF5 二级结构 B细胞抗原表位 |
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