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肝螺杆菌MCSTP的基因克隆及生物信息学分析
引用本文:牛凌云,白杨,郭蒸,夏国盛,李菁,秦和平,王继德.肝螺杆菌MCSTP的基因克隆及生物信息学分析[J].南方医科大学学报,2009,29(6):1212.
作者姓名:牛凌云  白杨  郭蒸  夏国盛  李菁  秦和平  王继德
作者单位:南方医科大学南方医院消化疾病研究所,广东,广州,510515
摘    要:目的 克隆肝螺杆菌(H.hepatieus)基基团接受趋化信号转导蛋白(MCSTP)全基因,并应用生物信息学方法对其进行分析.方法 以肝螺杆菌全基因组作为模板,设计肝螺杆菌MCSTP c1977特异性引物,利用PCR方法扩增目的 基因片段,连接至原核表达载体pET22b(+).从而构建原核表达质料pET22b+/MCSTP并测序鉴定.廊用牛物信息学方法分析MCSTP基囚的序列同源性及其结构特征.结果 克隆的MCSTP基因经测序可知与GenBank公布的肝螺杆菌标准株ATCC51449序列一致性达99%,仅第1 160 bp处由A变为T.利用生物信息学方法进行分析可发现此基因与空肠弯曲杆菌、幽门螺杆菌具有非常低的相似性,表明其在微生物界巾具有一定的特异性.结论 成功构建pET22b+/MCSTP重组质粒,并通过生物信息学技术进行序列及结构分析,为进一步研究其生物学功能及致病机制提供了线索和依据.

关 键 词:肝螺杆菌  基因克隆  生物信息学

Cloning and bioinformatics analysis of recombinant methyl-accepting chemotaxis signal transduction protein of Helicobacter hepaticus
NIU Ling-yun,BAI Yang,GUO Zheng,XIA Guo-sheng,LI Jing,QIN He-ping,WANG Ji-de.Cloning and bioinformatics analysis of recombinant methyl-accepting chemotaxis signal transduction protein of Helicobacter hepaticus[J].Journal of Southern Medical University,2009,29(6):1212.
Authors:NIU Ling-yun  BAI Yang  GUO Zheng  XIA Guo-sheng  LI Jing  QIN He-ping  WANG Ji-de
Institution:NIU Ling-yun,BAI Yang,GUO Zheng,XIA Guo-sheng,LI Jing,QIN He-ping,WANG Ji-de Institute of Digestive Diseases,Nanfang Hospital,Southern Medical University,Guangzhou,510515,China
Abstract:Objective To clone the gene encoding methyl-accepting chemotaxis signal transduction protein (MCSTP) of Helicobacter hepaticus and analyze the gene structures using bioinformatics methods. Methods With the specific primer of Helicobacter hepaticus MCSTP c1977, MCSTP gene was amplified by PCR from the genomic DNA of Helicobacter hepaticus and ligated to the prokaryotic expression vector pET22b(+). After sequencing, the sequence homology and structural feature of MCSTP gene were analyzed by bioinformatics met...
Keywords:MCSTP
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