| 基于3D Slicer应用程序构建大鼠小脑外形微细结构信息数据库 |
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| 引用本文： | 李莉,丁库克,刘霞,李慧,宋一志,景朋,陆涛.基于3D Slicer应用程序构建大鼠小脑外形微细结构信息数据库[J].中国组织工程研究与临床康复,2007,11(22):4296-4299. |
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| 作者姓名： | 李莉 丁库克 刘霞 李慧 宋一志 景朋 陆涛 |
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| 作者单位： | 1. 首都医科大学基础医学院解剖教研室,北京市,100069
2. 首都医科大学生物工程学院,北京市,100069 |
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| 摘 要： | 目的:建立大鼠小脑外形三维重构的可视化数据集,为小脑中央核团的三维重建摸索一个可行的方案。方法:实验于2003-03/2005-05在首都医科大学解剖教研室实验室完成。取SD大鼠5只,麻醉后处死取小脑,固定后进行冰冻连续切片、贴片,后经尼氏染色,用扫描仪对各切片进行投射扫描,图像大小为(1868×1491),获取原始图像数据库,并通过首都医科大学生物工程学院开发的配准软件及图像处理软件photoshop7.0对数据库中的数据进行半自动配准及人工分割,应用哈佛大学开发的图像处理专业软件3DSlicer对分割后的数据库进行三维重建。并应用牙科Cad-cam仪器对小脑外形进行扫描,获取完整的小脑外形图像。结果:①小脑尼氏染色获得的原始图像共159张,图像边缘清晰,可见深染的皮质和浅染的白质部分,白质间的小脑中央核深染,边界清晰。②共获得159个小脑外形的三维表面模型数据库(.vtk文件)。在3DSlicer应用程序上可选择小脑外形的三维表面模型数据进行三维显示,并构建了它们的动画显示文件(.gif),使用WindowsMediaPlayer应用软件即可以播放;与应用牙科Cad-cam仪器对小脑表面扫描获取的小脑表面的图像比较,信息更饱满,图像更真实,层次感强。结论:通过切片、配准、分割等方法获得了大鼠小脑外形微细结构信息的数据库,此法更适用于组织微细结构的三维重建。
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| 关 键 词： | 小脑 三维重建 组织切片 |
| 文章编号： | 1673-8225（2007）22-04296-04 |
| 修稿时间： | 2007-01-312007-04-19 |
Reconstructing rat cerebellum microstructure database using 3D Slicer |
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| Li L,Ding KK,Liu X,Li H,Song YZ,Jing P,Lu T.Reconstructing rat cerebellum microstructure database using 3D Slicer[J].Journal of Clinical Rehabilitative Tissue Engineering Research,2007,11(22):4296-4299. |
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| Authors: | Li L Ding KK Liu X Li H Song YZ Jing P Lu T |
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| Institution: | Department of Anatomy, Preclinical Medicine College, 2 Biomedical Engineering College, Capital University of Medical Science, Beijing 100069, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | 3D Slicer |
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