糖尿病肾病和糖尿病视网膜病变应激相关关键基因的生物信息学分析

目的:通过生物信息学方法分析共同影响糖尿病肾病(diabetic nephropathy, DN)和糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy, DR)发生发展的应激相关关键基因。方法:从DisGeNET、CTD、Genecards数据库收集DN和DR的共致病基因数据，通过STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作网络图，进行共致病基因的GO和KEGG富集分析。同时，利用“limma”包筛选出GEO数据库中DN和DR数据集的共同差异基因，通过MCC插件筛选出Top20基因，并对两个芯片数据集进行GSEA富集分析。筛选出上述两组基因数据共同的应激相关关键基因，对其进行相关性和富集分析。最后，借助GeneMANIA、NetworkAnalyst 3.0、DGIdb数据库，构建蛋白互作网络以及TF-miRNA-gene网络，并预测应激相关关键基因的靶向治疗药物。结果:我们发现了5个高度正相关的应激相关关键基因(CCL2、THBS1、PECAM1、SPARC、POSTN),在高糖环境下，它们可通过介导应激反应影响肾脏以及视网膜的细胞外基质重构和炎症。同时，我们预测了...