基于生物信息学分析受体酪氨酸磷酸酶U对胃癌免疫微环境的影响

目的 分析TCGA数据库中胃癌数据集,探讨受体酪氨酸磷酸酶U(PTPRU)对胃癌免疫微环境的影响。方法 获取TCGA数据库中胃癌的RNA-seq数据集,共提取33对配对样本。使用R语言的Limma包分析差异基因,并使用CIBERSORT算法评估胃癌样本中的免疫微环境组成。结果 胃癌组织中PTPRU基因表达升高,且与人表皮生长因子受体2(HER-2)基因表达升高具有较高的相关性。通过CIBERSORT算法进一步评估胃癌样本中免疫微环境发现,B细胞、辅助性T细胞及T细胞调节细胞的浸润深度均升高(均P<0.05),单核细胞的浸润深度下降(P<0.05)。结论 PTPRU的高表达可能通过抑制微环境中的免疫细胞功能,引起胃癌的发生发展。