| 江苏汉族人群基因多态性与HapMap数据库的比较 |
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| 引用本文： | 陈志军,邱勇,王斌,俞杨,朱泽章. 江苏汉族人群基因多态性与HapMap数据库的比较[J]. 江苏医药, 2009, 35(4) |
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| 作者姓名： | 陈志军 邱勇 王斌 俞杨 朱泽章 |
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| 作者单位： | 南京大学医学院附属鼓楼医院脊柱外科,210008 |
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| 基金项目： | 南京市中青年拔尖人才资助项目 |
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| 摘 要： | 目的 评价HapMap数据库在江苏汉族人群(JS)的应用价值.方法 江苏地区汉族172名无血缘关系的健康体检青少年,选取Matrilin-1基因中9个标签SNPs进行PCR-RFLP基因分型,比较JS汉族人群与HapMap数据库的北京汉族(CHB)、日本(JPT)、CHB+JPT、欧洲(CEU)及非洲(YRI)的等位基因频率、连锁不平衡结构及单体型频率的差异.并分别以JS、CHB、JPT、CHB+JPT、CEU及YRI为参考选取标签SNPs(r2≥0.8为标准),比较其差异.结果 与JS的等位基因频率、连锁不平衡结构及单体型频率比较,HapMap数据库中CHB相关程度最高.比较以各人种数据为参考选择的标签SNPs,以JS为参考和以CHB及CHB+JPT为参考选择的标签SNPs完全相同.结论 HapMap数据库中的CHB分型数据可作为JS人群复杂疾病多态性研究的参考数据库.
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| 关 键 词： | 人类基因组单体型图 标签SNP 多态性 汉族 江苏 |
Comparison of gene polymorphisms between Jiangsu Chinese population and HapMap samples |
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