m6A修饰调控的LDB2抑制肺腺癌细胞增殖

LIM-domain binding protein 2 regulated by m6A modification inhibits lung adenocarcinoma cell proliferation in vitro

目的研究LIM域结合蛋白2（LDB2）在肺腺癌中的表达模式及作用。方法从mRNA和蛋白表达数据库中分析在肺腺癌中表达下调基因的交集。通过qRT-PCR、Western blot和免疫组化的方法验证LDB2在肺腺癌中的表达模式。在GEO和TCGA数据库中分析LDB2与肺腺癌患者预后的相关性。在H1299细胞中过表达LDB2，通过细胞计数实验、软琼脂克隆实验及流式细胞术证明LDB2在肺腺癌中的作用。生信预测结合后期MeRIP-qPCR实验证实LDB2转录本上存在m⁶A结合位点。通过qRT-PCR和Western blot实验检测YTHDC2对LDB2的转录调控。RIP实验验证YTHDC2能否与LDB2转录本结合。结果通过分析TCGA、GEO及CPTAC 3个数据集中在肺腺癌中低表达的差异基因，最终聚焦于LDB2基因。免疫组化结果证实该基因在80例肺腺癌组织中的表达量也显著低于17例正常癌旁组织的表达量。与正常肺上皮细胞16HBE相比，LDB2在肺腺癌细胞中的表达量亦明显降低。生信分析提示高表达的LDB2与肺腺癌患者良好的预后正相关。在H1299细胞中过表达LDB2后，发现LDB2可诱导H1299细胞发生S期阻滞，从而抑制该细胞的增殖能力和软琼脂克隆形成能力。生信预测结合后期MeRIPqPCR实验证实LDB2转录本上存在m⁶A位点。GEPIA数据库提示YTHDC2在肺腺癌组织中低表达，且与LDB2在肺腺癌中表达正相关（r=0.22，P < 0.0001）。在H1299细胞中过表达YTHDC2，可明显增加LDB2的表达。最后，在过表达YTHDC2的H1299细胞中开展RIP实验，定量结果显示LDB2在YTHDC2组的含量是其在IgG组含量的19.35倍，YTHDC2可结合在LDB2转录本上调控其表达。双荧光素酶报告基因实验证实YTHDC2可上调野生型而不是缺失型报告基因载体活性。结论m⁶A编码器YTHDC2在肺腺癌中上调LDB2的表达。过表达LDB2可明显诱导肺腺癌细胞发生S期阻滞，抑制肺腺癌细胞增殖能力。