2009～2010年泰安市手足口病病原体基因型特征分析

目的检测泰安市手足口病的主要病原体EV71和CoxA16,并进行分子生物学分析,了解泰安市手足口病致病病毒的基因型特征。方法采用Real-time PCR法检测肠道病毒EV71和CoxA16;采用Nested PCR和RT-PCR扩增VP1区片段并测序。用DNASTAR、Bioedit、MEGA4等软件进行序列分析。结果与各基因亚型参考株的VP1序列进行对比,泰安市分离株EV71的基因亚型为C4a型,CoxA16可分为B1a、B1b两个基因亚型。结论泰安市分离株EV71属于我国的优势基因型C4a型。CoxA16可分为B1a、B1b两亚型,表明泰安市存在不同的传播链,对公众健康构成威胁,提示应加强对泰安市手足口病的监测及其流行规律的研究。