广东新型甲型H1N1病毒血凝素基因分子进化与变异 |
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引用本文: | 梁丽君,钟静,黄平,苏文哲,何剑峰,张欣,武婕,杨芬,邹丽容. 广东新型甲型H1N1病毒血凝素基因分子进化与变异[J]. 中华微生物学和免疫学杂志, 2013, 33(3): 173-177 |
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作者姓名: | 梁丽君 钟静 黄平 苏文哲 何剑峰 张欣 武婕 杨芬 邹丽容 |
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作者单位: | 1. 广东省疾病预防控制中心广东省应急病原学检测重点实验室,广州,511430 2. 广州市胸科医院传染科,510095 |
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基金项目: | 国家自然科学基金,广东省医学科学研究基金项目 |
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摘 要: | 目的 揭示广东地区2009-2011年新型H1N1病毒血凝素基因(HA)进化特征及抗原表位变异特征.方法 采用时空抽样方法抽样,检测2009-2011年广东分离的24株新型H1N1病毒HA基因核苷酸序列,与GenBank中44株国外相应序列比较;比对HA基因核苷酸序列,分析基因分子变异,构建分子遗传动力学MCMC进化树;同时分析2009-2011年广东毒株HA基因的抗原表位变异情况.结果 68株HA基因进化树显示,广东毒株进化树主干至少分为6大分支;其中2011年毒株聚类为2个(Ⅴ和Ⅵ)主要分支,各具基因特征.变异频率较高的位点包括391、467、202和214位,正向选择位点包括8、145和391;广东毒株抗原表位区发生S145L/P、L208I、Q240R、S160G和G187R位点变异.2009年广东毒株HA基因分支Ⅰ毒株可能于2010年传播到亚洲、欧洲和澳洲地区.结论 广东新型H1N1病毒HA基因变异具有传播特征(Ⅰ)和地区特征(Ⅵ),位于抗原表位Ca、Sa和Sb的氨基酸发生变异,其中位点145等变异频率较高,承受着正向选择压力.
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关 键 词: | 新型H1N1病毒 血凝素 表位 进化 变异 |
Evolution and mutation of H1N1pdm virus hemagglutinin genes in Guangdong |
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Abstract: | |
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Keywords: | H1N1pdm Hemagglutinin (HA) Epitope Evolution Mutation |
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