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高通量测序方法分析实验室培养对人体口腔唾液菌群的影响
引用本文:石雨婷,夏文君,邹岩,漆正楠,段胜仲,唐子圣.高通量测序方法分析实验室培养对人体口腔唾液菌群的影响[J].口腔医学,2018,38(12):1062-1067.
作者姓名:石雨婷  夏文君  邹岩  漆正楠  段胜仲  唐子圣
作者单位:1. 上海交通大学医学院附属第九人民医院2. 上海市口腔病防治院3. 上海市口腔医学重点实验室/上海市口腔医学研究所,国家口腔疾病临床研究中心
基金项目:国家重点研发计划项目;中国科学院重大科技基础设施开放研究项目
摘    要:目的 研究实验室培养对口腔唾液菌群结构及其多样性的影响。方法 本实验选取6个健康且符合纳入排除标准的志愿者,采集口腔唾液菌群样本并进行实验室培养。基于Illumina Hiseq测序平台,我们利用16S rDNA高通量测序技术,研究实验室培养对人体口腔唾液细菌的影响,分析了培养前后的菌群物种丰度和菌群结构差异。结果 高通量测序一共得到618个OTUs,测序分析显示人体口腔唾液菌群在实验室培养前后,菌群生物多样性的差异无统计学意义(P>0.05),菌群构成的差异无统计学意义(P>0.05)。OTUs Venn图显示实验室培养前后,人体口腔唾液菌群拥有大约78.4%相同物种。结论 16S rDNA高通量测序分析显示,人体口腔唾液菌群在实验室培养前后具有相似性。

关 键 词:16S  rRNA  口腔微生态  唾液  高通量测序  
收稿时间:2018-05-17
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