高通量测序方法分析实验室培养对人体口腔唾液菌群的影响 |
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引用本文: | 石雨婷,夏文君,邹岩,漆正楠,段胜仲,唐子圣.高通量测序方法分析实验室培养对人体口腔唾液菌群的影响[J].口腔医学,2018,38(12):1062-1067. |
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作者姓名: | 石雨婷 夏文君 邹岩 漆正楠 段胜仲 唐子圣 |
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作者单位: | 1. 上海交通大学医学院附属第九人民医院2. 上海市口腔病防治院3. 上海市口腔医学重点实验室/上海市口腔医学研究所,国家口腔疾病临床研究中心 |
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基金项目: | 国家重点研发计划项目;中国科学院重大科技基础设施开放研究项目 |
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摘 要: | 目的 研究实验室培养对口腔唾液菌群结构及其多样性的影响。方法 本实验选取6个健康且符合纳入排除标准的志愿者,采集口腔唾液菌群样本并进行实验室培养。基于Illumina Hiseq测序平台,我们利用16S rDNA高通量测序技术,研究实验室培养对人体口腔唾液细菌的影响,分析了培养前后的菌群物种丰度和菌群结构差异。结果 高通量测序一共得到618个OTUs,测序分析显示人体口腔唾液菌群在实验室培养前后,菌群生物多样性的差异无统计学意义(P>0.05),菌群构成的差异无统计学意义(P>0.05)。OTUs Venn图显示实验室培养前后,人体口腔唾液菌群拥有大约78.4%相同物种。结论 16S rDNA高通量测序分析显示,人体口腔唾液菌群在实验室培养前后具有相似性。
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关 键 词: | 16S rRNA 口腔微生态 唾液 高通量测序 |
收稿时间: | 2018-05-17 |
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