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直接测序与克隆测序检测不育男性H19基因甲基化印记的比较
引用本文:丁婷,岳磊,余波澜,周华,袁静茹,刘敏,孙筱放.直接测序与克隆测序检测不育男性H19基因甲基化印记的比较[J].分子诊断与治疗杂志,2011,3(4).
作者姓名:丁婷  岳磊  余波澜  周华  袁静茹  刘敏  孙筱放
作者单位:广州医学院第三附属医院妇产科研究所,广州市生殖与遗传重点实验室,广东,广州,510150
摘    要:目的 建立亚硫酸氢盐修饰后测序技术,比较直接测序与克隆测序在不育男性精子印记基因DNA甲基化状态检测中的差别.方法 对样本进行精液分析和精子形态学分析,密度梯度离心法制备精液.提取精液基因组DNA并行亚硫酸氢盐处理,行半巢式PCR,将纯化后PCR产物与pCR 2.1-TOPO 载体连接及转化,分别对PCR产物及阳性克隆菌液进行测序.结果 PCR产物直接测序,前半部分序列丢失约40bp,1号CpG位点甲基化状态信息丢失.每例标本只有-个测序结果,会出现CpG位点的部分甲基化状态.挑取15个克隆进行测序,序列无丢失,18个CpG位点甲基化状态信息均完整.15个克隆CpG位点甲基化状态有所不同,显示出此样本的平均甲基化状态.结论 克隆测序不会造成序列丢失,CpG位点甲基化状态信息完整,克隆测序能较好地反应样本的平均甲基化状态.

关 键 词:男性不育  H19基因  甲基化印记  亚硫酸氢盐修饰后测序法  直接测序  克隆测序

A Comparison between direct sequencing and clone sequencing in detection for methylation imprinting of H19 gene in infertile males
DING Ting,YUE Lei,YU Bolan,ZHOU Hua,YUAN Jingru,LIU Min,SUN Xiaofang.A Comparison between direct sequencing and clone sequencing in detection for methylation imprinting of H19 gene in infertile males[J].Journal of Molecular Diagnosis and Therapy,2011,3(4).
Authors:DING Ting  YUE Lei  YU Bolan  ZHOU Hua  YUAN Jingru  LIU Min  SUN Xiaofang
Abstract:
Keywords:
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