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基于3个微血管侵犯相关lncRNA的肝细胞癌预后模型的构建
作者姓名:吴丹丹  杨顶  冯奕森  罗育  周素芳
作者单位:1. 广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室广西高校生物分子医学研究重点实验室区域性高发肿瘤早期防治研究教育部重点实验室广西重点实验室;2. 国家生物靶向诊治国际联合研究中心
摘    要:目的:构建与肝细胞癌(HCC)微血管侵犯(MVI)相关的长链非编码RNA(lncRNA)预后风险模型,筛选关键MVImRNA。方法:基于TCGA-LIHC数据库获得转录组数据,提取MVI-mRNA,通过相关性分析和单因素Cox分析获得预后相关的MVI-lncRNA,多因素Cox分析筛选变量构建相关风险模型。采用Kaplan-Meier分析、单因素和多因素Cox分析、受试者工作特征(ROC)曲线及主成分分析(PCA)对风险模型进行评估。按照高、低风险分组对34个HCC-MVI-mRNA进行差异分析,并进行GO、KEGG富集分析。采用RNA-seq和RT-qPCR验证HCC患者癌组织和癌旁组织中MVI-mRNA。结果:共鉴定了9种预后相关的MVI-lncRNA,通过3个MVI高度相关lncRNA:AC129492.1、NRAV、AC099850.3构建了具有预后价值的MVI-lncRNA风险模型。高风险组总生存期(OS)短于低风险组(P<0.05)。ROC结果表明风险评分(AUC=0.819,95%CI:1.576~2.250)比临床因素更准确地预测患者的生存。按高、低风险分组对MV...

关 键 词:肝细胞癌  微血管侵袭  预后模型
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