hsa-miR-133a在人食管鳞状细胞癌细胞株中的表达及其生物信息学分析北大核心CSCD

目的探讨hsa-miR-133a在人食管鳞状细胞癌细胞株中的表达,并对其靶基因进行预测和生物信息学分析,为深入研究hsa-miR-133a的功能提供理论指导。方法通过实时荧光定量PCR法,检测人食管鳞状细胞癌细胞株KYSE-150、Eca109和正常食管上皮细胞株Het-1A中hsa-miR-133a的相对表达;应用TargetScan、PicTar及miRanda预测hsa-miR-133a的靶基因,取三者预测结果的交集,并结合DIANALAB-TarBase5.0和miRTarBase两个实验证实的基因数据库,进行功能注释和通路富集分析。结果人食管鳞状细胞癌细胞株KYSE150、Eca109中hsa-miR-133a的表达水平显著低于正常食管上皮细胞;hsa-miR-133a的靶基因显著富集在与肿瘤密切相关的AKT和p53信号通路。结论 hsa-miR-133a可能是参与调控食管鳞状细胞癌致病的靶基因。