| 基于线粒体12S基因对青藏高原细粒棘球蚴种群遗传结构的研究 |
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| 引用本文： | 延宁,聂华明,蒋忠荣,邓世金,余华,严玉宝,达瓦次仁,孔维淑,谢跃,付彦,杨德英,古小彬,杨光友. 基于线粒体12S基因对青藏高原细粒棘球蚴种群遗传结构的研究[J]. 中国人兽共患病杂志, 2013, 29(1): 10-16 |
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| 作者姓名： | 延宁 聂华明 蒋忠荣 邓世金 余华 严玉宝 达瓦次仁 孔维淑 谢跃 付彦 杨德英 古小彬 杨光友 |
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| 作者单位： | 四川农业大学动物医学院;四川省甘孜州畜牧科学研究所;四川出入境检验检疫局;西藏自治区动物疫病预防控制中心;西藏那曲地区职业技术学校 |
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| 基金项目： | 国家科技支持计划项目(2006BAI06B09);国家质检总局科技计划项目(2009IK019)~~ |
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| 摘 要： | 目的分析青藏高原细粒棘球蚴的种群遗传结构,为细粒棘球蚴病的防控提供基础资料。方法对采自青藏高原来自不同地区(青海、西藏、四川)不同宿主(人、绵羊、牛)的58株细粒棘球蚴进行了线粒体12S基因的全序列测序,结合已报道的青海地区42个细粒棘球蚴绵羊株的12S全序列进行种群遗传结构分析。结果本次研究56个分离株鉴定为Echino-coccus.granulosus sensu stricto(基因型G1–G3);分析98个青藏高原地区分离株12S序列,包含15个核苷酸变异位点,共检测出13个单倍型(ES1～ES13),单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.381、0.00092。3个地域种群中,四川种群的核苷酸多样性最高(0.001353),种群内遗传距离最大(0.00135)。分子变异分析(AMOVA)显示,种群内的遗传变异大于种群间的遗传变异。构建单倍型NJ树和贝叶斯树显示,ES10和ES11形成一个有别于其他单倍型的单倍型类群。单倍型网络显示,单倍型ES1是优势单倍型,其它单倍型围绕它成辐射状,未发现有地理聚类。基因流(Nm值)和遗传分化指数(FST值)显示各地域种群间未形成显著的遗传分化。结论青藏高原细粒棘球绦虫的基因型为G1-G3型;青藏高原细粒棘球绦虫种群内及种群间都存遗传多样性,其中四川种群的遗传变异性最大;青藏高原细粒棘球绦虫种群内变异是种群变异的主要来源;种群未形成地理聚类,遗传分化不明显。
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| 关 键 词： | 细粒棘球蚴 12S基因 种群遗传机构 青藏高原 |
Population genetic structure of Echinococcus granulosus in Qinghai-Tibetan Plateau based on mtDNA 12S gene |
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| YAN Ning,NIE Hua-ming,JIANG Zhong-rong,DENG Shi-jin,YU Hua,YAN Yu-bao,DAWA Ciren,KONG Wei-shu,XIE Yue,FU Yan,YANG De-ying,GU Xiao-bin,YANG Guang-you. Population genetic structure of Echinococcus granulosus in Qinghai-Tibetan Plateau based on mtDNA 12S gene[J]. Chinese Journal of Zoonoses, 2013, 29(1): 10-16 |
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| Authors: | YAN Ning NIE Hua-ming JIANG Zhong-rong DENG Shi-jin YU Hua YAN Yu-bao DAWA Ciren KONG Wei-shu XIE Yue FU Yan YANG De-ying GU Xiao-bin YANG Guang-you |
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| Affiliation: | 1(1.College of Veterinary Medicine,Sichuan Agricultural University,Ya’an 625014,China; 2.Gazi Animal Science Institute,Kangding 626000,China; 3.Sichuan Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau,Chengdu 610041,China; 4.Tibet Autonomous Region Center for Animal Diseases Prevention and Control,Lhasa 850000,China; 5.Nagqu Vocational and Technical School,Nagqu 852000,China) |
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