| SARS冠状病毒检测60 mer寡核苷酸基因芯片的设计及应用 |
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| 引用本文： | 石嵘,马文丽,吴清华,张宝,宋艳斌,郭秋野,肖维威,王艳,郑文岭.SARS冠状病毒检测60 mer寡核苷酸基因芯片的设计及应用[J].广东医学,2003,24(Z1):14-17. |
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| 作者姓名： | 石嵘 马文丽 吴清华 张宝 宋艳斌 郭秋野 肖维威 王艳 郑文岭 |
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| 作者单位： | 1. 第一军医大学全军生物芯片重点实验室,中国人民解放军基因工程研究所,广州,510515
2. 广州军区广州总医院医学实验科,广州,510010 |
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| 摘 要： | 目的设计并应用60 mer寡核苷酸基因芯片实现对SARS冠状病毒的检测.方法根据寡核苷酸基因芯片的设计原则设计出30条60 mer的寡核苷酸片段,覆盖SARS冠状病毒(以TOR2株为参考序列,GENEBANK索取号:AY274119)全基因组,点样制备成12×12的寡核苷酸基因芯片,将临床诊断SARS患者痰液标本抽提病毒RNA,采用限制性显示技术进行标记,将标记好的样品与芯片杂交,洗脱,扫描.初步探索寡核苷酸芯片诊断SARS冠状病毒的敏感性及特异性,并对芯片做进一步的优化.结果来自SARS患者样品与芯片上的多个SARS探针杂交,出现了明显的荧光信号;阴性和空白对照探针上没有杂交信号,而对照样品仅与一个SARS探针有杂交.结论采用60 mer寡核苷酸基因芯片可以从基因水平实现对SARS冠状病毒多段序列的平行检测,对于提高检出率有一定意义,此外,尚可用于监测在发病过程的各个阶段中病毒基因的活动状况.
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| 关 键 词： | SARS冠状病毒 寡核苷酸基因芯片 RD-PCR 荧光标记 分子杂交 |
| 修稿时间： | 2003年5月28日 |
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