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应用基因芯片技术检测结核分枝杆菌耐异烟肼基因型
引用本文:张俊仙,吴雪琼,邢婉丽,梁艳,阳幼荣,李洪敏. 应用基因芯片技术检测结核分枝杆菌耐异烟肼基因型[J]. 河北医科大学学报, 2008, 29(4)
作者姓名:张俊仙  吴雪琼  邢婉丽  梁艳  阳幼荣  李洪敏
作者单位:解放军总医院第二附属医院结核病研究室,北京,100091;生物芯片北京国家工程研究中心,北京,102206
基金项目:国家科技专项基金 , 军队杰出人才基金
摘    要:目的研制一种新型DNA芯片,用于快速检测结核分枝杆菌耐异烟肼katG基因突变。方法根据结核分枝杆菌katG基因序列设计探针并制作DNA芯片,用四甲基罗丹明标记的引物扩增结核分枝杆菌katG基因突变热点的片断,与DNA芯片杂交,同时以聚合酶链反应-单链构象多态性(pdymerase chain reaction-single stranded conformation polymorphism,PCR-SSCP)和DNA测序法为对照。结果153株结核分枝杆菌临床分离株中30株异烟肼敏感株的PCR-SSCP和DNA芯片杂交结果与结核分枝杆菌标准株完全相同,123株异烟肼耐药株中有85株检测到katG基因突变,占69.1%(85/123)。其中83株为315位密码子AGC→ACC突变,2株为315位密码子AGC→AAC突变,该突变与PCR-SSCP和DNA芯片杂交结果一致;余38株未检测到突变,经测序证实其中1株PCR-SSCP有不同突变的为279位密码子GGC→GAC突变,因芯片上未点该位点的探针,所以杂交结果为阴性。结论用DNA芯片可快速、特异地检测出大多数结核分枝杆菌耐异烟肼分离株的katG基因突变,可用于临床耐药性的检测,指导临床用药。

关 键 词:分枝杆菌  结核  异烟肼  药物耐受性

RAPID DETECTION OF katG MUTATIONS IN MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS BY DNA CHIP
ZHANG Jun-xian,WU Xue-qiong,XING Wan-li,LIANG Yan,YANG You-rong,LI Hong-min. RAPID DETECTION OF katG MUTATIONS IN MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS BY DNA CHIP[J]. Journal of Hebei Medical University, 2008, 29(4)
Authors:ZHANG Jun-xian  WU Xue-qiong  XING Wan-li  LIANG Yan  YANG You-rong  LI Hong-min
Abstract:
Keywords:mycobacterium  tuberculosis  isoniazid  drug tolerance
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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