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SPR天然产物小分子抑制剂的“人工智能”药物筛选和“网络药理”作用机制研究
引用本文:艾中柱,王皓南,周珊珊,江经纬,袁胜涛,黄必胜,杜鸿志.SPR天然产物小分子抑制剂的“人工智能”药物筛选和“网络药理”作用机制研究[J].世界科学技术-中医药现代化,2021,23(4):1119-1128.
作者姓名:艾中柱  王皓南  周珊珊  江经纬  袁胜涛  黄必胜  杜鸿志
作者单位:湖北中医药大学药学院 武汉 430065;中药资源与中药化学湖北省重点实验室 武汉 430065,湖北中医药大学药学院 武汉 430065,湖北中医药大学中医临床学院 武汉 430065,中国药科大学国家(南京)新药筛选中心 南京 210009,中国药科大学国家(南京)新药筛选中心 南京 210009,湖北中医药大学药学院 武汉 430065,湖北中医药大学药学院 武汉 430065;中药资源与中药化学湖北省重点实验室 武汉 430065
基金项目:The Science and Technology Research Project of Hubei Provincial Department of Education (No.Q20192007)
摘    要:目的 基于“人工智能”药物筛选,获得墨蝶呤还原酶(SPR)的潜在小分子抑制剂。同时,针对最佳的候选SPR天然小分子抑制剂,利用“网络药理学”开展抗肿瘤作用机制探究。方法 首先,搜集多个平台数据构建天然小分子化合物库,利用“三重积分协同过滤计分系统”进行“人工智能”药物筛选,获得候选的SPR天然小分子抑制剂。随后,利用“分子对接”和中药系统药理学分析平台(TCMSP)系统分析,初步评价出最佳候选者。最后,通过SIB和STITCH数据库获得最佳抑制剂的作用靶标、蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络和网络拓扑参数,导入Cytoscape系统对网络进行分析,筛选关键靶标。通过DAVID数据库进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测其抗肿瘤作用机制。结果 筛选出候选抑制剂1783个;从得分前20的化合物中,分析筛选出刺囊酸可能最佳SPR天然产物小分子抑制剂;获得其关键靶点。GO富集结果表明刺囊酸可能主要涉及到RNA聚合酶II启动子的转录,细胞增殖的调控和G蛋白偶联受体信号途径等生物学过程;KEGG富集表明可能涉及癌症信号通路,蛋白多糖信号通路等。结论 天然小分子化合物可能是SPR抑制剂的重要来源,刺囊酸可能是最佳的SPR天然小分子抑制剂。总之,本研究可能为天然产物小分子抑制剂的研究开发提供启示。

关 键 词:墨蝶呤还原酶  天然产物  中药  “人工智能”药物筛选  网络药理学
收稿时间:2020/6/12 0:00:00
修稿时间:2021/4/27 0:00:00

Artificial intelligence drug screening and network pharmacology mechanism of natural products-derived small molecule inhibitors of sepiapterin reductase
Ai Zhongzhu,Wang Haonan,Zhou Shanshan,Jiang Jinwei,Yuan Shengtao,Huang Bisheng and Du Hongzhi.Artificial intelligence drug screening and network pharmacology mechanism of natural products-derived small molecule inhibitors of sepiapterin reductase[J].World Science and Technology-Modernization of Traditional Chinese Medicine,2021,23(4):1119-1128.
Authors:Ai Zhongzhu  Wang Haonan  Zhou Shanshan  Jiang Jinwei  Yuan Shengtao  Huang Bisheng and Du Hongzhi
Institution:School of Pharmacy, Hubei University of Chinese Medicine, Wuhan 430065, China;Key Laboratory of Traditional Chinese Medicine Resources and Chemistry of Hubei Province, Hubei University of Chinese Medicine, Wuhan 430065, China,School of Pharmacy, Hubei University of Chinese Medicine, Wuhan 430065, China,Clinical Medical College of TCM, Hubei University of Chinese Medicine, Wuhan 430065, China,National Center for Drug Screening (Nanjing), China Pharmaceutical University, Nanjing 210009, China,National Center for Drug Screening (Nanjing), China Pharmaceutical University, Nanjing 210009, China,School of Pharmacy, Hubei University of Chinese Medicine, Wuhan 430065, China,School of Pharmacy, Hubei University of Chinese Medicine, Wuhan 430065, China;Key Laboratory of Traditional Chinese Medicine Resources and Chemistry of Hubei Province, Hubei University of Chinese Medicine, Wuhan 430065, China
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