宏基因组二代测序技术在脊柱感染病原微生物诊断中的应用

【摘要】 目的：探讨宏基因组二代测序（metagenomic next-generation sequencing，mNGS）技术在脊柱感染疾病中诊断病原微生物的能力和价值。方法：纳入2019年1月～2020年12月收治的46例疑似脊柱感染患者，其中男性26例，女性20例；年龄26～77岁（50.4±15.7岁）。获取患者的血液和病灶组织或脓液标本（CT引导下穿刺活检21例，开放手术25例），行微生物培养、血清学检测、病理检查和mNGS检测后进行结果的比较分析。结果：46例标本均在48h内获得了mNGS结果，微生物培养、血清学检测、病理检查等传统实验室检测时间1~12d不等。经临床最终诊断共35例为脊柱感染，11例为非脊柱感染。35例脊柱感染患者中，化脓性细菌感染14例，结核感染5例，布鲁菌属感染4例，未明确病原微生物感染12例；11例非脊柱感染患者中，脊柱肿瘤3例，终板Modic改变4例，终板骨折1例，DISH病合并假关节1例，强直性脊柱炎合并假关节2例。通过mNGS检测发现了脆弱拟杆菌、微小微单胞菌、齿垢密螺旋体、贝纳柯克斯体等少见病原微生物。mNGS在种水平与临床最终诊断的一致性为82.61%（19/23），在属水平的一致性为95.65%（22/23）。微生物培养阳性率为42.86%（15/35），mNGS检测阳性率为94.29%（33/35），二者存在统计学差异（P＜0.01）。mNGS检测的敏感度为91.43%，特异度为90.91%，阳性预测值96.97%，阴性预测值76.92%。结论：宏基因组二代测序技术检测病原微生物快速、高效、准确，在脊柱感染疾病的诊疗中有较高的诊断价值。

Pathogenic detection by metagenomic next-generation sequencing in spinal infections