| 罗马洋甘菊吉马烯A合成酶基因的克隆与表达分析 |
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| 引用本文： | 闫佳萍,孟想想,朱丽,张威威,常杰,许锋.罗马洋甘菊吉马烯A合成酶基因的克隆与表达分析[J].中草药,2017,48(9):1851-1859. |
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| 作者姓名： | 闫佳萍 孟想想 朱丽 张威威 常杰 许锋 |
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| 作者单位： | 长江大学园艺园林学院, 湖北 荆州 434025;长江大学园艺园林学院, 湖北 荆州 434025;长江大学园艺园林学院, 湖北 荆州 434025;长江大学园艺园林学院, 湖北 荆州 434025;靶向抗肿瘤药物湖北省协同创新中心, 湖北 荆门 448000;荆楚理工学院化工与药学院, 湖北 荆门 448000;长江大学园艺园林学院, 湖北 荆州 434025 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（31400603）；大学生创新创业训练计划项目（201207014） |
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| 摘 要： | 目的从罗马洋甘菊Chamaemelum nobile中克隆萜类化合物合成关键酶吉马烯A合成酶(germacrene A synthase,GAS)cDNA全长,并对其进行生物信息学和组织表达分析。方法基于前期对罗马洋甘菊转录组测序结果,设计特异性引物,利用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增得到GAS的cDNA全长,利用生物信息学手段对其核苷酸和编码的氨基酸序列进行分析,并预测其编码的蛋白质的理化性质和功能。通过实时定量PCR技术(qRT-PCR)检测罗马洋甘菊GAS基因(CnGAS)在罗马洋甘菊不同组织的表达水平。结果扩增得到的罗马洋甘菊吉马烯A合成酶基因的cDNA全长为1 785 bp,命名为CnGAS(GenBank登录号为KU589283),包含1个1 683 bp的开放阅读框(ORF),编码561个氨基酸,预测的相对分子质量和等电点分别为6 470和5.21。CnGAS基因编码的氨基酸序列与其他植物的GAS蛋白高度同源,且含有DDxx D保守序列。系统进化树表明CnGAS基因与菊科植物的GAS基因的亲缘关系最近。qRT-PCR结果显示CnGAS基因在罗马洋甘菊各组织中均有表达,且花中表达量最高。结论从罗马洋甘菊中克隆得到CnGAS基因,分析了该基因在不同组织中的表达水平,为罗马洋甘菊萜类化合物的生物合成代谢途径的研究奠定了基础。
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| 关 键 词： | 罗马洋甘菊 吉马烯A合成酶 基因克隆 生物信息学 基因表达 |
| 收稿时间： | 2016/12/15 0:00:00 |
Molecular cloning and expression analysis of germacrene A synthase gene in Chamaemelum nobile |
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| YAN Jia-ping,MENG Xiang-xiang,ZHU Li,ZHANG Wei-wei,CHANG Jie and XU Feng.Molecular cloning and expression analysis of germacrene A synthase gene in Chamaemelum nobile[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2017,48(9):1851-1859. |
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| Authors: | YAN Jia-ping MENG Xiang-xiang ZHU Li ZHANG Wei-wei CHANG Jie and XU Feng |
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| Institution: | College of Horticulture and Gardening, Yangtze University, Jingzhou 434025, China;College of Horticulture and Gardening, Yangtze University, Jingzhou 434025, China;College of Horticulture and Gardening, Yangtze University, Jingzhou 434025, China;College of Horticulture and Gardening, Yangtze University, Jingzhou 434025, China;Hubei Collaborative Innovation Center of Targeted Antitumor Drug, Jingmen 448000, China;College of Chemical Engineering and Pharmacy, Jingchu University of Technology, Jingmen 448000, China;College of Horticulture and Gardening, Yangtze University, Jingzhou 434025, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Chamaemelum nobile L germacrene A synthase gene cloning bioinformatics gene expression |
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