| Channel catfish重组激活基因克隆与鉴定 |
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| 引用本文： | 公衍文,张云,黄庆,张雪,府伟灵.Channel catfish重组激活基因克隆与鉴定[J].第三军医大学学报,2004,26(8):700-703. |
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| 作者姓名： | 公衍文 张云 黄庆 张雪 府伟灵 |
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| 作者单位： | 第三军医大学西南医院检验科,重庆,400038;第三军医大学西南医院检验科,重庆,400038;第三军医大学西南医院检验科,重庆,400038;第三军医大学西南医院检验科,重庆,400038;第三军医大学西南医院检验科,重庆,400038 |
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| 摘 要： | 目的尝试用简并引物扩增序列未知的channel catfish基因组DNA中ragl基因的片段并测序,为ragl基因的早期进化模式和遗传学变异情况的研究提供直接的证据.方法基于ragl基因的高度保守设计简并引物,PCR扩增channel catfish基因组DNA中ragl基因的片段,TA克隆并双向测序.将所得序列资料拼接,用多种生物信息学方法分析其ORF、内含子、与其它物种ragI基因及Ragl蛋白的相似性,并做多序列比较和系统进化树分析.结果扩增出3条chan-nel catfish ragl基因的DNA片段.从拼接后的序列中找到一2 235bp的ORF和一293bp的内含子,所得序列与其它物种ragl基因的相似程度高(多大于70%),去除内含子后的channel catfish ragl基因序列与zebrafish、rainbow trout、bull shark的ragl基因cDNA全序列碱基一致的位点占43.9%,自第1 352位碱基至2 925位碱基为53.1%,而自第1位碱基至1 351位碱基为33.2%,有非常显著的差异(P＜0.01).结论用简并引物成功扩增出channel catfish ragl基因的DNA片段.序列在GenBank中的登记号是:AY423858(去除内含子序列),AY423859.ragl基因进化缓慢,高度保守,不同物种ragI基因的变异相对集中在氨基末端的区域.系统进化树分析显示了13种硬骨鱼在进化上关系的亲疏.
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| 关 键 词： | 重组激活基因 v(D)J重排 聚合酶链反应 简并引物 生物信息学 |
| 文章编号： | 1000-5404(2004)08-0700-04 |
| 修稿时间： | 2003年11月18 |
Cloning and identification of the rag 1 gene in channel catfish |
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| GONG Yan wen,ZHANG Yun,HUANG Qing,ZHANG Xue,FU Wei ling.Cloning and identification of the rag 1 gene in channel catfish[J].Acta Academiae Medicinae Militaris Tertiae,2004,26(8):700-703. |
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| Authors: | GONG Yan wen ZHANG Yun HUANG Qing ZHANG Xue FU Wei ling |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | recombination activating gene V(D)J rearrangement polymerase chain reaction degenerate primer bioinformatics |
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