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基于免疫基因组学的结肠腺癌患者预后风险模型的建立
作者姓名:陈恩更  陈力  曹高扬  王飞  章玮  周玮  宋章法
作者单位:浙江大学医学院附属邵逸夫医院肛肠外科,杭州 310016;浙江大学医学院附属邵逸夫医院肛肠外科,杭州 310016;浙江大学医学院附属邵逸夫医院肛肠外科,杭州 310016;浙江大学医学院附属邵逸夫医院肛肠外科,杭州 310016;浙江大学医学院附属邵逸夫医院肛肠外科,杭州 310016;浙江大学医学院附属邵逸夫医院肛肠外科,杭州 310016;浙江大学医学院附属邵逸夫医院肛肠外科,杭州 310016
摘    要:目的探索影响结肠腺癌患者预后的免疫基因,构建结肠腺癌患者的预后风险模型。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取结肠腺癌患者的RNA-seq数据及临床病例资料。根据组织样本分为肿瘤组与对照组,筛选出差异表达的免疫基因。通过Cox回归分析筛选出与结肠腺癌患者预后相关的免疫基因,并构建预后风险评分模型。计算每例结肠腺癌患者的风险评分,根据中位风险评分将其分为高风险组和低风险组,通过Kaplan-Meier分析及受试者工作特征(ROC)曲线对免疫基因预后风险模型的预测效能进行评价,并对免疫基因预后风险模型与免疫细胞浸润的相关性进行分析。结果肿瘤组与对照组共存在220个差异表达的免疫基因,COX回归分析显示其中CXCL5(C-X-C motif chemokine ligand 5)、IGHV5-51(immunoglobulin heavy variable 5-51)、IGKV1-33(immunoglobulin kappa variable 1-33)、CHGA(chromogranin A)、UCN(urocortin)、VIP(vasoactive intestinal pep...

关 键 词:结肠腺癌  免疫基因  癌症基因组图谱  预后  个体化诊疗
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