基于免疫基因组学的结肠腺癌患者预后风险模型的建立 |
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作者姓名: | 陈恩更 陈力 曹高扬 王飞 章玮 周玮 宋章法 |
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作者单位: | 浙江大学医学院附属邵逸夫医院肛肠外科,杭州 310016;浙江大学医学院附属邵逸夫医院肛肠外科,杭州 310016;浙江大学医学院附属邵逸夫医院肛肠外科,杭州 310016;浙江大学医学院附属邵逸夫医院肛肠外科,杭州 310016;浙江大学医学院附属邵逸夫医院肛肠外科,杭州 310016;浙江大学医学院附属邵逸夫医院肛肠外科,杭州 310016;浙江大学医学院附属邵逸夫医院肛肠外科,杭州 310016 |
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摘 要: | 目的探索影响结肠腺癌患者预后的免疫基因,构建结肠腺癌患者的预后风险模型。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取结肠腺癌患者的RNA-seq数据及临床病例资料。根据组织样本分为肿瘤组与对照组,筛选出差异表达的免疫基因。通过Cox回归分析筛选出与结肠腺癌患者预后相关的免疫基因,并构建预后风险评分模型。计算每例结肠腺癌患者的风险评分,根据中位风险评分将其分为高风险组和低风险组,通过Kaplan-Meier分析及受试者工作特征(ROC)曲线对免疫基因预后风险模型的预测效能进行评价,并对免疫基因预后风险模型与免疫细胞浸润的相关性进行分析。结果肿瘤组与对照组共存在220个差异表达的免疫基因,COX回归分析显示其中CXCL5(C-X-C motif chemokine ligand 5)、IGHV5-51(immunoglobulin heavy variable 5-51)、IGKV1-33(immunoglobulin kappa variable 1-33)、CHGA(chromogranin A)、UCN(urocortin)、VIP(vasoactive intestinal pep...
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关 键 词: | 结肠腺癌 免疫基因 癌症基因组图谱 预后 个体化诊疗 |
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