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细粒棘球蚴中国大陆株谷胱甘肽s-转移酶结构与功能的生物信息学分析
引用本文:棘怀庆,孙俊锋,雄英,李宗吉,王娅娜,赵巍. 细粒棘球蚴中国大陆株谷胱甘肽s-转移酶结构与功能的生物信息学分析[J]. 宁夏医科大学学报, 2009, 31(2): 150-153,157
作者姓名:棘怀庆  孙俊锋  雄英  李宗吉  王娅娜  赵巍
作者单位:宁夏医科大学医学科学技术研究中心,银川,750004  
摘    要:目的 应用生物信息学分析软件预测细粒棘球蚴中国大陆株谷胱甘肽s-转移酶(EgGST)氨基酸序列的结构与功能.方法 应用DNAStar、NCBI/BLAST、Bioetm、SWISS-MODEL等生物信息学软件分析EgGsr的基因序列,推算出其编码的氨基酸序列与其他物种的同源序列,进行多序列同源比对,构建分子进化树;预测二级结构、拓扑结构;同源模建预测三级结构;预测主要抗原表位等.结果 经RT-PCR扩增得到的660bpEgGSIDNA片段,经DNAman分析软件同源性比较发现,与GenBank中检索的EgGST基因序列同源性为99%;EgGST与不同生物间的同源性平均达45%;该基因编码的蛋白分子量为25492.53Da,有219个氨基酸,等电点为7.532,有31个酸性氨基酸,32个碱性氨基酸,52个极性氨基酸和7个非极性氨基酸;有8个抗原表位肽段15G-29R,30E-39C,40S-68R,69G-82Q,83I-90M,91D-120A,121P-133Q,134L-144N.结论 EgGST可能是免疫诊断、药物作用及疫苗潜在的靶分子.

关 键 词:细粒棘球蚴中国大陆株  谷胱甘肽s-转移酶  生物信息学

Bioinformatics Analysis for the Structure and Function of Glutathione S-tramferase Gene from Echinococcus Granulosus (Chinese Mainland Strain)
JI Huai-qing,SUN Jun-feng,XIONG Ying,LI Zong-ji,WANG Ya-na,ZHAO Wei. Bioinformatics Analysis for the Structure and Function of Glutathione S-tramferase Gene from Echinococcus Granulosus (Chinese Mainland Strain)[J]. Journal of Ningxia Medical College, 2009, 31(2): 150-153,157
Authors:JI Huai-qing  SUN Jun-feng  XIONG Ying  LI Zong-ji  WANG Ya-na  ZHAO Wei
Abstract:
Keywords:
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