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基于生物信息学多数据库探讨半夏泻心汤干预胃癌细胞焦亡的分子机制题录
作者姓名:郭杨  喻斌  徐寅
作者单位:湖南中医药大学第一附属医院脾胃病科
基金项目:国家自然科学基金(81904176);;湖南省自然科学基金(2020JJ4483);
摘    要:目的基于生物信息学多种数据库, 探讨半夏泻心汤(BXXXD)干预胃癌(GC)细胞焦亡(pyroptosis)的分子机制, 为胃癌患者生存、预后提供新思路。方法本研究使用到的生物信息学数据库包括中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional TCMSP)、有机小分子生物活性数据(Pubchem)、String、人类基因的综合数据库(Genecard)、基因表达综合数据库(GEO)、癌症基因组图谱(TCGA)等。首先利用中药复方网络药理学方法获取"半夏泻心汤→胃癌→细胞焦亡"共有靶点并对其进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析;其次利用GEO数据库对胃癌芯片进行差异分析, 绘制其差异表达基因(DEGs)火山图及热图, 并利用韦恩图获取"半夏泻心汤→胃癌DEGs"共有靶点。通过TCGA数据库获取临床胃癌患者信息, 比较正常组、胃癌组相关靶点的表达水平差异, 并分析各靶点的表达水平与胃癌患者临床病理特征的关系。结果半夏泻心汤干预胃癌细胞焦亡共有29个靶点, 多生物进程、多细胞组分、多分子功能、多条KEGG信号通路发挥作用, 其中最主要的可能是:在细胞质中, 分子...

关 键 词:胃肿瘤  细胞焦亡  半夏泻心汤  生物信息学  差异分析
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