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海马钙素类1在原发性中枢神经系统淋巴瘤中表达和临床预后的生物信息学分析
作者姓名:于建宇  郑义  李文斌
作者单位:首都医科大学附属北京天坛医院神经肿瘤综合治疗病区
基金项目:国家自然科学基金项目(81972338);
摘    要:目的 基于生物信息学分析原发性中枢神经系统淋巴瘤(primary central nervous system lymphoma, PCNSL)中海马钙素类1(hippocalcin like 1,HPCAL1)的表达水平及临床意义,进而推断HPCAL1在PCNSL中的作用。方法 通过基因表达数据库(Gene Expression Omnibus database, GEO)GSE25297数据集下载7例PCNSL组织和7例正常脑组织的表达数据和临床信息,绘制HPCAL1表达水平诊断价值的受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve, ROC);从GSE34771数据集中下载34例PCNSL患者的表达数据及临床信息,并以HPCAL1表达量的中位值分为高低表达两组,绘制高低表达组的生存曲线、HPCAL1表达量及临床信息的多因素预后分析、高低表达两组差异表达基因的火山图以及热图、差异表达基因的基因本体(Gene Ontology, GO)分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Ge...

关 键 词:海马钙素类1  原发性中枢神经系统淋巴瘤  生物标志物
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