PIWI interacting RNA通路相关基因作为肠癌生物标志物的研究

目的:筛选与结直肠癌(colorectal cancer, CRC)诊断预后相关的piRNA通路相关基因。方法:基于癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)数据库中647个结直肠肿瘤样本和51个非肿瘤样本，分析39个piRNA通路相关基因在组织水平的表达情况，并构建风险预后模型。利用生存曲线(KM曲线)和受试者工作特征曲线(ROC曲线)评估测量模型的预测性能、效果。最后，结合临床病理特征挑选候选分子，在细胞水平进行验证并分析其在免疫微环境中的作用。结果:37个有显著差异的piRNA通路相关基因中有8个基因共同构建风险预后模型。KM曲线分析显示模型与肠癌预后的关系：CRC高危组患者总生存期(OS)显著降低；ROC曲线显示模型的诊断效能：在1、3、5年范围内该模型的曲线下面积分别为0.624、0.669、0.670。肠癌中POLR2F和PAICS在分子水平及蛋白水平均呈现高表达，且表达水平与临床病理学特征相关。尤其PAICS表达水平与CRC中肿瘤免疫浸润细胞呈正相关，在癌相关成纤维细胞中显著低表达。结论:piRNA通路相关基因，尤其是POLR2F和PAI...