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北柴胡达玛烯二醇合成酶基因克隆及表达分析
引用本文:冯飞雪,吕瑞华,李依民,高静,梁伟伟,王战争,颜永刚,张岗.北柴胡达玛烯二醇合成酶基因克隆及表达分析[J].中草药,2023,54(23):7815-7822.
作者姓名:冯飞雪  吕瑞华  李依民  高静  梁伟伟  王战争  颜永刚  张岗
作者单位:1. 陕西中医药大学附属医院;2. 陕西中医药大学医学技术学院;3. 陕西中医药大学药学院/陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室
基金项目:陕西省重点研发计划项目(2022SF-542);;陕西省科技计划一般项目(青年项目)(2023-JC-QN-0944);
摘    要:目的 克隆北柴胡Bupleurem chinense达玛烯二醇合成酶(dammarenediol synthase,DS)基因BcDS,并进行生物信息学及表达模式分析。方法 通过搜索转录组数据库,利用RT-PCR克隆开放阅读框(open reading frame,ORF)和启动子区。通过生物信息在线工具预测基因编码蛋白的理化性质、结构域、信号肽、三级结构等分子特征,利用Jalview软件进行氨基酸多序列比对,采用MEGA 11.0软件进行分子进化分析。运用实时荧光定量PCR检测基因表达模式。结果 BcDS ORF长2115 bp,编码的蛋白包涵704个氨基酸,相对分子质量为80 770,为酸不稳定的亲水蛋白,无跨膜结构域或信号肽。BcDS与人参、西洋参等植物DS的相似性高,具有达玛烯二醇合成酶特征结构域,且BcDS与人参、西洋参、三七等DS聚为一支。BcDS启动子区域含有响应环境及植物激素的顺式作用元件。BcDS在根中的表达量最高,分别为茎、叶和花中BcDS表达量的5.81、10.44和7.86倍,并受茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)和水杨酸(salicyli...

关 键 词:北柴胡  表达模式  基因克隆  生物信息学分析  茉莉酸甲酯  水杨酸
收稿时间:2023/4/10 0:00:00

Cloning and expression analysis of dammarenediol synthase gene in Bupleurum chinense
FENG Fei-xue,LYU Rui-hu,LI Yi-min,GAO Jing,LIANG Wei-wei,WANG Zhan-zheng,YAN Yong-gang,ZHANG Gang.Cloning and expression analysis of dammarenediol synthase gene in Bupleurum chinense[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2023,54(23):7815-7822.
Authors:FENG Fei-xue  LYU Rui-hu  LI Yi-min  GAO Jing  LIANG Wei-wei  WANG Zhan-zheng  YAN Yong-gang  ZHANG Gang
Institution:Affiliated Hospital of Shaanxi University of Chinese medicine, Xianyang 712000, China;College of Medical Technology, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xianyang 712046, China;Key Laboratory for Research and Development of"Qin Medicine"of Shaanxi Administration of Chinese Medicine, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China
Abstract:
Keywords:Bupleurem chinense DC    expression pattern  gene cloning  bioinformatics analysis  methyl jasmonate  salicylic acid
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