ODC1基因对前列腺癌细胞PC-3 LncRNA表达影响的初步观察与分析 |
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引用本文: | 宋尖卓,马健,陈鹏.ODC1基因对前列腺癌细胞PC-3 LncRNA表达影响的初步观察与分析[J].新疆医科大学学报,2024(4):526-532. |
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作者姓名: | 宋尖卓 马健 陈鹏 |
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作者单位: | 新疆医科大学附属肿瘤医院泌尿科 |
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基金项目: | 新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2022D01C285); |
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摘 要: | 目的 探讨鸟氨酸脱羧酶1(ODC1)基因对前列腺癌细胞PC-3 LncRNA表达的影响,为进一步研究其作用及调控机制提供一些实验基础和线索。方法 以前列腺癌细胞PC-3作为研究对象,敲低ODC1基因,经q-PCR检测及WB检测验证后采用Illumina Novaseq 6000,PE150模式进行高通量测序,测序结果应用编码潜能分析方法(CPC分析、CNCI分析、CPAT分析、LGC分析)进行预测筛选,对筛选出的lncRNAs行差异分析、顺式作用元件分析以及GO和KEGG富集分析。再选择文献报道中与前列腺癌关系密切的几个功能lncRNAs,采用q-PCR进行验证。结果 (1)在ODC1敲低PC-3细胞中筛选到341个lncRNA,差异表达的lncRNA中上调154个,下调128个。符合条件的差异lncRNA与差异表达基因共表达的顺式调控靶标有38个。(2)差异表达lncRNAs行GO和KEGG富集分析显示,lncRNA靶标基因参与体内多种生物学通路,如磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B信号通路(PI3K-Akt信号通路)、Ras信号通路等,还与肿瘤血管生成、细胞群增殖、正调控细胞分裂等密切相...
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关 键 词: | 前列腺癌 ODC1基因 lncRNA 差异表达 |
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