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聚合酶链反应-反向点杂交法检测遗传性耳聋相关基因的热点突变
引用本文:张彦,刘晶晶,叶秋萍,李印淑. 聚合酶链反应-反向点杂交法检测遗传性耳聋相关基因的热点突变[J]. 中华妇幼临床医学杂志(电子版), 2018, 14(3): 270-276. DOI: 10.3877/cma.j.issn.1673-5250.2018.03.004
作者姓名:张彦  刘晶晶  叶秋萍  李印淑
作者单位:1. 511442 广州,广东省妇幼保健院医学遗传中心2. 518000 广东深圳,亚能生物技术(深圳)有限公司
摘    要:目的探讨聚合酶链反应-反向点杂交(PCR-RDB)法对遗传性耳聋相关基因突变检测的准确性和实用性。 方法选择2014年1月至2016年10月,于广东省妇幼保健院临床诊断为非综合征型耳聋(NSHI)的250例患者为研究对象。采用PCR-RDB法检测其外周血遗传性耳聋相关基因突变。PCR-RDB法采用遗传性耳聋基因芯片检测试剂盒,可检测中国人群常见的4个耳聋相关基因的12个热点突变,即GJB2(35del G、176_191del 16、235del C、299_300del AT),GJB3(538C>T),SLC26A4(1174A>T、1226G>A、1229C>T、IVS7-2A>G、2168A>G)及线粒体MTRNR1(1494C>T、1555A>G)。同时,所有DNA样本均采用金标准Sanger测序法进行对比验证。本研究符合2013年修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》,并征得受试者知情同意。 结果①本研究来自250例受试者的250例DNA样本中,耳聋相关基因突变检出率为51.6%(129/250),其中GJB2基因突变检出率为28.4%(71/250),SLC26A4基因突变为19.2%(48/250),线粒体MTRNR1基因突变为4.4%(11/250),GJB3基因突变为2.0%(5/250);129例检出的耳聋相关基因突变中,符合遗传病致病特征的耳聋相关基因突变的几率为86.8%(112/129)。②PCR-RDB法与Sanger测序法,对12个耳聋相关基因热点突变的检测结果均相同。③PCR-RDB法检测12个耳聋相关基因热点突变的灵敏度、特异度、总一致性、阳性预测值及阴性预测值均为100.0%。 结论虽然PCR-RDB法检测耳聋相关基因突变的结果与金标准Sanger测序法一致,但是本研究样本量尚小,因此是否可满足临床对遗传性耳聋基因检测的需求,则需多中心、大样本随机对照试验进一步研究、证实。

关 键 词:非综合征型耳聋  聚合酶链反应  寡核苷酸序列分析  基因型  核酸杂交  突变  
收稿时间:2017-10-09

Detection of gene hot spots mutation in genetic deafness associated gene by polymerase chain reaction-reverse dot blot technique
Yan Zhang,Jingjing Liu,Qiuping Ye,Yinshu Li. Detection of gene hot spots mutation in genetic deafness associated gene by polymerase chain reaction-reverse dot blot technique[J]. Chinese JOurnal of Obstetrics & Gynecology and Pediatrics, 2018, 14(3): 270-276. DOI: 10.3877/cma.j.issn.1673-5250.2018.03.004
Authors:Yan Zhang  Jingjing Liu  Qiuping Ye  Yinshu Li
Affiliation:1. Center for Medical Genetics, Guangdong Women and Children Hospital, Guangzhou 511442, Guangdong Province, China2. Yaneng Bioscience (Shenzhen) Co., Ltd., Shenzhen 518000, Guangdong Province, China
Abstract:
Keywords:Nonsyndromic deafness  Polymerase chain reaction  Oligonucleotide array sequence analysis  Genotype  Nucleic acid hybridization  Mutation  
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