| 4种DNA条形码在黄毛鼠种类鉴定中的比较 |
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| 引用本文： | 胡群,马思杰,裘炯良. 4种DNA条形码在黄毛鼠种类鉴定中的比较[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2015, 26(3): 286-289 |
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| 作者姓名： | 胡群 马思杰 裘炯良 |
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| 作者单位： | 1. 大榭出入境检验检疫局鼠传疾病检测实验室,浙江宁波,315812
2. 宁波出入境检验检疫局 |
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| 摘 要： | 目的 比较CO Ⅰ、Cytb、16S rRNA、D-loop四个DNA条形码对黄毛鼠鼠种的鉴定效果.方法 将大榭港区捕获的1只黄毛鼠样本HX41,提取基因组DNA,使用特异性引物对线粒体CO Ⅰ、Cytb、16S rRNA、D-loop基因进行扩增并对扩增产物进行测序.将测序结果与GenBank中的相似鼠种DNA构建分子进化树进行同源性分析.结果 以CO Ⅰ、Cytb、D-loop基因所构建分子进化树中,黄毛鼠均能独立形成分支,且HX41均处于黄毛鼠分支上.HX41的CO Ⅰ基因序列与黄毛鼠HN158株遗传距离最为接近,值为0.0034;Cytb基因序列与黄胸鼠HN99株遗传距离最为接近,值为0.0355,但HN99鼠种数据存在错误;D-loop基因序列与黄毛鼠HN105株遗传距离最为接近,值为0.0439.由于现有GenBank中缺少黄毛鼠16S rRNA基因序列,无法构建进化树.结论 对鼠种进行分子鉴定时,有必要根据GenBank数据库的完整性和准确性选择合适的DNA条形码.
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| 关 键 词： | 黄毛鼠 种类鉴定 DNA条形码 |
Comparison of four DNA barcoding in Rattus losea identification |
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| HU Qun , MA Si-jie , QIU Jiong-liang. Comparison of four DNA barcoding in Rattus losea identification[J]. Chinese Journal of Vector Biology and Control, 2015, 26(3): 286-289 |
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| Authors: | HU Qun MA Si-jie QIU Jiong-liang |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Rattus losea Species identification DNA barcoding |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
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