基于mt COI基因序列的DNA条形码技术在江苏沿江长角血蜱鉴定中的应用 |
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引用本文: | 杨鹏飞,燕清丽,苏琦,何芳,唐丽,邢亚东,刘纯成,邵忠贤,蔡蓉,胡锦流,姚海波,何南江.基于mt COI基因序列的DNA条形码技术在江苏沿江长角血蜱鉴定中的应用[J].江苏预防医学,2018(2). |
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作者姓名: | 杨鹏飞 燕清丽 苏琦 何芳 唐丽 邢亚东 刘纯成 邵忠贤 蔡蓉 胡锦流 姚海波 何南江 |
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作者单位: | 淮安市疾病预防控制中心 |
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摘 要: | 目的了解长角血蜱在盱眙地区(JS种群)的遗传多样性和不同地理种群间的分子进化关系,为该地区长角血蜱及其携带的病原体防控提供理论依据。方法采集盱眙县1例发热伴血小板减少综合征(SFTSV)确诊病例家附近的长角血蜱,并对其mt COI基因序列进行系统进化分析、种群遗传多样性分析及遗传结构分析。结果采集寄生蜱20只,游离蜱23只。JS种群的mt COI基因的核苷酸同源性为97.00%~100.00%,属"Compound"进化谱系枝。JS种群共有5个单倍型,单倍型多样性Hd=0.917,核苷酸多样性为π=0.005,多态性位点S=9。Tajima's D值为-1.456,核苷酸错配分布图为单峰。结论江苏沿江地区长角血蜱JS种群可能经历种群的扩张。
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关 键 词: | 长角血蜱 系统进化树 种群遗传多样性 种群遗传结构 |
Application of DNA barcoding technolodge based on the mitochondrial gene COI to identify Haemaphysalis longicornis along the Yangtse River in Jiangsu province |
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Abstract: | |
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