肝细胞癌铜死亡相关lncRNA预后模型的构建及评估 |
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引用本文: | 马健钧,熊永强,王博,刘琪,李韧,张澍.肝细胞癌铜死亡相关lncRNA预后模型的构建及评估[J].循证医学,2023(3):156-168. |
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作者姓名: | 马健钧 熊永强 王博 刘琪 李韧 张澍 |
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作者单位: | 1. 咸阳市长武县人民医院普通外科;2. 西安交通大学第二附属医院干部病房普通外科;3. 陕西省第二人民医院呼吸科;4. 西安交通大学第二附属医院临床技能中心 |
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摘 要: | 目的 探究铜死亡相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者中的预后价值及其在治疗中的潜在价值。方法 从肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中收集肝细胞癌的转录组数据及对应患者的临床资料。筛选癌组织与正常肝组织差异表达的铜死亡相关基因,并进行基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析。筛选与肝细胞癌预后相关的铜死亡lncRNA,对肝细胞癌患者进行分组并比较总体生存率。采用最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)Cox回归分析建立预后风险模型。建立用于预测肝细胞癌患者总体生存率的列线图。结果 获得由5个铜死亡相关lncRNA组成的预后模型,包括:RPS6K6、SNRPEP2、PRELID2、GOT2和RTL8A。风险评...
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关 键 词: | 肝细胞癌 铜死亡 lncRNA 预后模型 免疫功能 |
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