NDC1基因在肝癌中的诊断及预后价值的生物信息学分析 |
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引用本文: | 吴嘉旭,胡明超,王强,俞文渊,许华.NDC1基因在肝癌中的诊断及预后价值的生物信息学分析[J].福建医药杂志,2023(1):7-12. |
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作者姓名: | 吴嘉旭 胡明超 王强 俞文渊 许华 |
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作者单位: | 南京医科大学附属江苏盛泽医院普外科南京医科大学康达学院盛泽临床医学院 |
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摘 要: | 目的 基于生物信息学的方法研究NDC1基因用于肝癌的诊断及预后评估方面的作用。方法 以TCGA数据库和GTEx为发现数据库,使用软件下载所有肝癌患者以及健康人的level 3 HTSeq-TPM格式的RNA测序结果,绘制箱式图及点图用于统计NDC1基因在肝癌组织及正常组织中的差异化表达情况,并使用GEPIA作为验证数据库进行佐证。绘制受试者曲线来评估NDC1基因用于诊断肝癌的效能。根据NDC1基因表达量的中位数将患者区分为NDC1高表达和低表达两组,研究肝癌患者的临床病理特征以及预后情况和NDC1基因表达的关系。绘制生存曲线,探究NDC1基因的高低表达与LIHC患者的生存情况的关系。结果 肝癌患者的NDC1的表达量为2.16(1.746~2.64),明显大于正常组织中的1.449(1.263~1.644),差异有统计学意义(P<0.05);同样的,在55对配对组织中,NDC1基因在肝癌组织中的表达量3.47(3.028~3.749)也明显高于对应的癌旁正常组织中NDC1的表达量2.426(2.278~2.611),差异有统计学意义(P<0.05)。受试者曲线的结果显示了ND...
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关 键 词: | 肝癌 NDC1基因 预后 生物信息学 |
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