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口腔肿瘤干细胞样细胞中锌指蛋白750的潜在靶蛋白筛选
作者姓名:姜博  于水  杨一昆  徐聪  杨红莉  陈海英
作者单位:1. 聊城市人民医院中心实验室;2. 聊城市人民医院样本库
基金项目:国家自然科学基金资助项目(81773759);
摘    要:目的 筛选锌指蛋白750(ZNF750)在口腔肿瘤干细胞样细胞(CSC-like cell)中的潜在靶蛋白。方法 (1)CSC-like cell的富集:采用肿瘤球形成实验富集口腔鳞癌(OSCC)细胞系TCA-83及CAL-27细胞中CSC-like cell细胞。(2) CSC-like cell细胞中ZNF750潜在靶蛋白筛选:将CSC-like cell分为oe-Con组(转导空载体慢病毒)及oeZNF750组(转导过表达ZNF750慢病毒),采用TMT标记定量蛋白质组学技术筛选两组差异表达蛋白,对差异表达蛋白进行生物信息学分析[GO、KEGG及IPR(结构域)分析],从差异表达蛋白中选择与ZNF750关系密切的候选蛋白[角鲨烯合酶(FDFT1)、与糖代谢相关的糖原合成酶(GYS1)、与核糖体相关的核糖体蛋白RPL15及40S核糖体蛋白RPS7以及具有结构分子活性的角蛋白6A、17(KRT6A、KRT17)]进行实时荧光定量PCR(qPCR)验证。从与ZNF750关系密切的候选蛋白中选择FDFT1(与类固醇生物合成有关兼具酶转运活性)作为兴趣蛋白,采用qPCR检测CSC-like...

关 键 词:锌指蛋白750  角鲨烯合酶  胆固醇代谢  肿瘤干细胞  蛋白组学测序技术  同位素标记定量技术  口腔鳞癌
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