| 利用生物信息学探索介导鲍曼不动杆菌血流感染的相关蛋白 |
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| 引用本文： | 冯文艳,张扣兴. 利用生物信息学探索介导鲍曼不动杆菌血流感染的相关蛋白[J]. 中国感染控制杂志, 2018, 17(12): 1060-1064. DOI: 10.3969/j.issn.1671-9638.2018.12.006 |
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| 作者姓名： | 冯文艳 张扣兴 |
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| 作者单位： | 利用生物信息学探索介导鲍曼不动杆菌血流感染的相关蛋白 |
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| 摘 要： | 目的探索介导鲍曼不动杆菌(AB)血流感染的相关蛋白,为AB血流感染提供新的研究方向。方法在AB基因数据库中检索多位点序列分型(MLST)相同,分离部位不同的AB菌株,采用生物信息学的方法分析仅存在于血流感染AB中的差异蛋白,并进行功能注释分析。结果在设定的检索条件下,共检索10株AB,按MLST分为3组,其中ST92型4株(分离自血、痰各2株)、ST137型4株(分离自血、痰各2株)、ST365型2株(分离自血、痰各1株)。基因、蛋白数据库分析结果显示,部分蛋白仅存在于血流感染AB中,不存在于分离自痰的AB中,其中ST92、ST137、ST365型血流感染AB中分别存在20、4、22个特有蛋白。特有蛋白参与的生物学过程主要集中在:细菌毒力与侵袭力、细菌代谢、DNA合成、DNA损伤及修复、转录、翻译、基因转座、以及噬菌体相关蛋白等通路上。结论由于个体差异性,同一MLST的AB上述蛋白表达的差异,可能是导致其发生血流感染的原因。
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| 关 键 词： | 鲍曼不动杆菌 血流感染 生物信息学 多位点序列分型 相关蛋白 |
| 收稿时间： | 2018-03-06 |
| 修稿时间： | 2018-05-12 |
Exploring on related proteins mediating Acinetobacter baumannii bloodstream infection based on bioinformatics |
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| FENG Wen yan,ZHANG Kou xing. Exploring on related proteins mediating Acinetobacter baumannii bloodstream infection based on bioinformatics[J]. Chinese Journal of Infection Control, 2018, 17(12): 1060-1064. DOI: 10.3969/j.issn.1671-9638.2018.12.006 |
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| Authors: | FENG Wen yan ZHANG Kou xing |
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| Affiliation: | The Third Affiliated Hospital of Sun Yat sen University, Guangzhou 510530, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Acinetobacter baumannii bloodstream infection bioinformatics multilocus sequence typing related protein |
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