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变应性鼻炎中lncRNA-miRNA-mRNA网络构建与相关程序性细胞死亡基因的分析
引用本文:王宇婷,姜辉,王嘉玺. 变应性鼻炎中lncRNA-miRNA-mRNA网络构建与相关程序性细胞死亡基因的分析[J]. 中国耳鼻咽喉颅底外科杂志, 2023, 29(3): 54-63
作者姓名:王宇婷  姜辉  王嘉玺
作者单位:北京中医药大学东方医院 耳鼻咽喉科, 北京 100078
基金项目:2021年度北京中医药大学附属医院校级课题(2021-BUCMXJKY010)。
摘    要:目的 本研究旨在探讨lncRNA介导的ceRNA网络在变应性鼻炎(AR)病理生理过程中的作用及其在程序性细胞死亡(PCD)中的潜在调控功能。方法 纳入AR患者与正常人,取全血进行RNA测序分析,筛选差异表达的lncRNA、miRNA和mRNA用于构建基于ceRNA理论的lncRNA-miRNA-mRNA调控网络。采用基因本体(GO)和KEGG富集分析来预测ceRNA网络中mRNA的潜在生物学功能。随后,将差异表达的mRNA与PCD相关基因相互取交集,并依据交集mRNA构建新的ceRNA网络,同时对ceRNA网络中mRNA进行靶器官定位网络分析。结果 基于生物信息学分析,共提取5个lncRNA、4个miRNA和46个mRNA,构建AR中lncRNA介导的上调及下调的ceRNA网络。功能富集分析显示其在“钙信号通路”、“PI3K/AKT信号通路”及“ERK1和ERK2级联”等中显著富集。并对AC008394.1及人类组织相容性白细胞抗原复合物P5(HCP5)2个lncRNA构建PCD相关ceRNA调控网络。在对ceRNA网络中mRNA进行靶器官定位分析中发现,它们多在神经免疫相关器官中表达。结论 本研究构建了AR中新的ceRNA网络,初步探索了HCP5介导的ceRNA网络可能通过影响细胞凋亡对AR发挥作用。为AR发病机制的研究提供了新的见解和潜在的研究方案。

关 键 词:变应性鼻炎  lncRNA  ceRNA网络  程序性细胞死亡  人类组织相容性白细胞抗原复合物P5
收稿时间:2022-02-08

Construction of lncRNA-miRNA-mRNA network and analysis of programmed cell death-related genes in allergic rhinitis
WANG Yuting,JIANG Hui,WANG Jiaxi. Construction of lncRNA-miRNA-mRNA network and analysis of programmed cell death-related genes in allergic rhinitis[J]. Chinese Journal of Otorhinolaryngology-skull Base Surgery, 2023, 29(3): 54-63
Authors:WANG Yuting  JIANG Hui  WANG Jiaxi
Affiliation:Department of Otolaryngology, Dongfang Hospital of Beijing University of Traditional Chinese Medicine, Beijing 100078, China
Abstract:
Keywords:Allergic rhinitis  lncRNA  ceRNA network  Programmed cell death  HCP5
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