基于代谢组学和转录组学的不同生长年限下银杏萜类生物合成关键基因表达分析 |
| |
引用本文: | 刘志强,高崎,李航,美芳,陈冉.基于代谢组学和转录组学的不同生长年限下银杏萜类生物合成关键基因表达分析[J].中草药,2022,53(4):1138-1147. |
| |
作者姓名: | 刘志强 高崎 李航 美芳 陈冉 |
| |
作者单位: | 上海上药杏灵科技药业股份有限公司, 上海 201703;上海中医药大学中药学院, 上海 201203;上海上药杏灵科技药业股份有限公司, 上海 201703 |
| |
基金项目: | 上海市国资委企业技术创新和能级提升项目(2018010) |
| |
摘 要: | 目的 以不同发育阶段不同树龄的银杏叶(银杏幼树叶,多年生银杏树叶)为对象,分析次生代谢物变化规律,测定黄酮及萜内酯含量,分析萜类生物合成的通路和关键基因表达,为提高银杏萜内酯产量提供分子生药学数据。方法 采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术,并进行高通量转录组学测序(RNA-seq),从差异表达基因中寻找次生代谢物生物合成的关联酶基因。结果 代谢数据表明,不同树龄,不同发育阶段的银杏叶次生代谢物明显不同,黄酮类成分,老树叶片与幼树叶4~7月含量均呈下降趋势;同发育阶段,幼树叶含量高于老树叶片含量;萜内酯类成分,老树叶片4~7月含量略微呈上升趋势,幼树叶略微呈缓降趋势;同发育阶段,幼树叶含量高于老树叶片含量。转录组分析出萌发期,老树叶片与幼树叶片生长状态相似,5~7月老树叶与幼树叶基因表达发生较大变化。筛选出49条与萜类合成有关的候选基因,分析后发现甲羟戊酸途径(mevalonatepathway,MVA)中老树叶表达高于幼树叶;甲基赤藻糖醇磷酸途径(methylerythritol4-phosphate pathway,MEP)中幼树叶表达高于老树叶。结论 幼树叶比老树叶药用活性成...
|
关 键 词: | 银杏 测序 转录组 代谢组 萜类 |
收稿时间: | 2021/8/6 0:00:00 |
|
| 点击此处可从《中草药》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《中草药》下载免费的PDF全文 |
|