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一种用于基因序列比较的并行计算方法
作者姓名:吴靖
摘    要:生物数据库的迅速发展,使计算机自动分析和比较显得日益重要。提高分析比较能力一般有三个途径:(1)提出新的更有效的序列分析方法;(2)研制用于序列分析的专用硬件;(3)更多地采用并行计算方法,这三种方法不一定是孤立的,常常是相互支持的。本文提出一种并行计算的方法:利用乘法器的功能,对相同问题进行并行处理。并行计算程序用一种与机型无关的编程语言C-linda编制,并同时在一个10CPU的Sequence Symmetry系统和一个64CPU的Intel Hypercube上进行了测试。C-linda以交互式内容定址存贮模式工作。这样多个过程可以进行通讯

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